Estudio de la microbiota fúngica asociada a la vegetación indicadora de arbustales xéricos interandinos de tres localidades del Ecuador
El objetivo de este estudio fue estudiar la microbiota fúngica asociada a la vegetación indicadora de los arbustales xéricos interandinos usando técnicas independientes de cultivo, para lo cual se recolectaron un total de 54 muestras en diferentes localidades interandinas del Ecuador, las muestras f...
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| Autor principal: | |
|---|---|
| Formato: | bachelorThesis |
| Idioma: | spa |
| Publicado em: |
2024
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| Assuntos: | |
| Acesso em linha: | https://dspace.espoch.edu.ec/handle/123456789/23515 |
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| Resumo: | El objetivo de este estudio fue estudiar la microbiota fúngica asociada a la vegetación indicadora de los arbustales xéricos interandinos usando técnicas independientes de cultivo, para lo cual se recolectaron un total de 54 muestras en diferentes localidades interandinas del Ecuador, las muestras fueron enviadas al laboratorio para su procesamiento. La extracción de ADN genómico fue tercerizada por la empresa BioSequence en Quito, la cual utilizó el kit de extracción comercial ZymoBIOMICS DNA Kits y el protocolo recomendado por la empresa. Para la preparación de librerías se utilizó el protocolo INDEX PCR. La base de datos utilizada es RefSeq RDP, basada en un conjunto de archivos FASTA con formato DADA2. Se utilizó una estadística descriptiva y multivariada de tipo no paramétrica para el análisis de información. Todos los análisis fueron realizados en el programa R versión 3.6. Los análisis obtenidos fueron a nivel de filo, clase, orden, familia y género. Los géneros de los hongos más evidentes encontrados a nivel de rizosfera y filosfera para las tres localidades fue Mortierella, Didymella, Cladosporium y Fusarium. Mediante este estudio se logró encontrar gran diversidad de microorganismos presentes tanto a nivel de rizosfera como filosfera de las tres localidades y cómo esto se interrelacionan con el manejo agrícola. |
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