Diagnostico molecular de gemivirus en plantaciones comerciales de tomate (solanum lycopersicum l.) y malezas asociadas al cultivo, en la provincia Santa Elena

Los geminivirus están constituidos por cuatro géneros, siendo los begomovirus los más destacados, debido a las características de su vector Bemisia tabaci y alta tasa de recombinación que exhiben. Esta familia ha provocado pérdidas estimadas entre 40 y 100% en diferentes cultivos de regiones tropica...

Ful tanımlama

Kaydedildi:
Detaylı Bibliyografya
Yazar: Ibarra Matamoros, María Alejandra (author)
Materyal Türü: bachelorThesis
Dil:spa
Baskı/Yayın Bilgisi: 2012
Konular:
Online Erişim:http://www.dspace.espol.edu.ec/handle/123456789/19351
Etiketler: Etiketle
Etiket eklenmemiş, İlk siz ekleyin!
_version_ 1839309601848164352
author Ibarra Matamoros, María Alejandra
author_facet Ibarra Matamoros, María Alejandra
author_role author
collection Repositorio Escuela Superior Politécnica del Litoral
dc.creator.none.fl_str_mv Ibarra Matamoros, María Alejandra
dc.date.none.fl_str_mv 2012-01-07
2012-01-07
2012-01-07
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.identifier.none.fl_str_mv http://www.dspace.espol.edu.ec/handle/123456789/19351
dc.language.none.fl_str_mv spa
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositorio Escuela Superior Politécnica del Litoral
instname:Escuela Superior Politécnica del Litoral
instacron:ESPOL
dc.subject.none.fl_str_mv GEMINIVIRUS
BEGOMOVIRUS
TECNICAS MOLECULARES
TOMATE
dc.title.none.fl_str_mv Diagnostico molecular de gemivirus en plantaciones comerciales de tomate (solanum lycopersicum l.) y malezas asociadas al cultivo, en la provincia Santa Elena
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
info:eu-repo/semantics/bachelorThesis
description Los geminivirus están constituidos por cuatro géneros, siendo los begomovirus los más destacados, debido a las características de su vector Bemisia tabaci y alta tasa de recombinación que exhiben. Esta familia ha provocado pérdidas estimadas entre 40 y 100% en diferentes cultivos de regiones tropicales y subtropicales como fréjol, tomate, melón, tabaco, calabaza, pimiento, entre otros. El presente trabajo tuvo la finalidad de diagnosticar, secuenciar e identificar por primera vez la presencia de geminivirus mediante la aplicación de técnicas moleculares en plantaciones de tomate (Solanum lycopersicum L.) y malezas (Luffa sp. e Ipomoea sp,) asociadas a este cultivo en la provincia Santa Elena-Ecuador. Se realizaron muestreos dirigidos en las plantaciones de tomate donde se observó: altas poblaciones de mosca blanca (B. tabaci) y síntomas relacionados con la presencia de geminivirus tales como amarillamiento, arrugamiento, clorosis, deformaciones, enanismo y enroscamiento de la hoja. Se realizó la extracción de ADN total de las muestras y para determinar la presencia de geminivirus se emplearon iniciadores dirigidos a amplificar la región central del gen que codifica para la cápside proteica (CP). Las muestras que amplificaron la región de interés fueron clonadas y secuenciadas; además se establecieron relaciones filogenéticas entre varios miembros del género Begomovirus que se encuentran afectando al tomate en América. El 34% de las muestras recolectadas en campo resultaron positivas en el diagnóstico inicial de geminivirus mediante el uso de cebadores degenerados, la mayoría de estas asociadas con síntomas de enrollamiento de la hoja y clorosis. En los análisis filogenéticos se demostró que el geminivirus encontrado presentaba una homología genética del 99% con el Virus de la deformación de la hoja de tomate (ToLDeV), una nueva especie de begomovirus identificada en Perú; encontrándose cuatro variaciones en la secuencia ecuatoriana, las cuales están ubicadas en los nucleótidos 71, 239, 240 y 450 remplazando G, T, C y T por A, A, G y C del ToLDeV. Dichas variaciones en los nucleótidos originaron que al convertirse en aminoácidos ciertos tripletes cambien: el codón que codifica para Arginina CGT (R) fue remplazado por una Histidina CAT (H), mientras que la variación TCT por AGT no ocasionó ningún cambio, ya que estos dos tipos de tripletes codifican para Serina (S); así mismo el cambio en la última base de TAT por TAC, no causa ninguna variación significante, codificando Tyrosina (Y) en las dos posiciones. Los resultados expuestos, constituyen los primeros en la identificación de esta nueva especie de geminivirus en el país afectando los cultivos de tomate y malezas acompañantes; sin embargo no se descarta la presencia de otras especies aún no identificadas.
eu_rights_str_mv openAccess
format bachelorThesis
id ESPOL_2d8100043d51134534968f4e1c6f1c36
instacron_str ESPOL
institution ESPOL
instname_str Escuela Superior Politécnica del Litoral
language spa
network_acronym_str ESPOL
network_name_str Repositorio Escuela Superior Politécnica del Litoral
oai_identifier_str oai:www.dspace.espol.edu.ec:123456789/19351
publishDate 2012
reponame_str Repositorio Escuela Superior Politécnica del Litoral
repository.mail.fl_str_mv .
repository.name.fl_str_mv Repositorio Escuela Superior Politécnica del Litoral - Escuela Superior Politécnica del Litoral
repository_id_str 1479
spelling Diagnostico molecular de gemivirus en plantaciones comerciales de tomate (solanum lycopersicum l.) y malezas asociadas al cultivo, en la provincia Santa ElenaIbarra Matamoros, María AlejandraGEMINIVIRUSBEGOMOVIRUSTECNICAS MOLECULARESTOMATELos geminivirus están constituidos por cuatro géneros, siendo los begomovirus los más destacados, debido a las características de su vector Bemisia tabaci y alta tasa de recombinación que exhiben. Esta familia ha provocado pérdidas estimadas entre 40 y 100% en diferentes cultivos de regiones tropicales y subtropicales como fréjol, tomate, melón, tabaco, calabaza, pimiento, entre otros. El presente trabajo tuvo la finalidad de diagnosticar, secuenciar e identificar por primera vez la presencia de geminivirus mediante la aplicación de técnicas moleculares en plantaciones de tomate (Solanum lycopersicum L.) y malezas (Luffa sp. e Ipomoea sp,) asociadas a este cultivo en la provincia Santa Elena-Ecuador. Se realizaron muestreos dirigidos en las plantaciones de tomate donde se observó: altas poblaciones de mosca blanca (B. tabaci) y síntomas relacionados con la presencia de geminivirus tales como amarillamiento, arrugamiento, clorosis, deformaciones, enanismo y enroscamiento de la hoja. Se realizó la extracción de ADN total de las muestras y para determinar la presencia de geminivirus se emplearon iniciadores dirigidos a amplificar la región central del gen que codifica para la cápside proteica (CP). Las muestras que amplificaron la región de interés fueron clonadas y secuenciadas; además se establecieron relaciones filogenéticas entre varios miembros del género Begomovirus que se encuentran afectando al tomate en América. El 34% de las muestras recolectadas en campo resultaron positivas en el diagnóstico inicial de geminivirus mediante el uso de cebadores degenerados, la mayoría de estas asociadas con síntomas de enrollamiento de la hoja y clorosis. En los análisis filogenéticos se demostró que el geminivirus encontrado presentaba una homología genética del 99% con el Virus de la deformación de la hoja de tomate (ToLDeV), una nueva especie de begomovirus identificada en Perú; encontrándose cuatro variaciones en la secuencia ecuatoriana, las cuales están ubicadas en los nucleótidos 71, 239, 240 y 450 remplazando G, T, C y T por A, A, G y C del ToLDeV. Dichas variaciones en los nucleótidos originaron que al convertirse en aminoácidos ciertos tripletes cambien: el codón que codifica para Arginina CGT (R) fue remplazado por una Histidina CAT (H), mientras que la variación TCT por AGT no ocasionó ningún cambio, ya que estos dos tipos de tripletes codifican para Serina (S); así mismo el cambio en la última base de TAT por TAC, no causa ninguna variación significante, codificando Tyrosina (Y) en las dos posiciones. Los resultados expuestos, constituyen los primeros en la identificación de esta nueva especie de geminivirus en el país afectando los cultivos de tomate y malezas acompañantes; sin embargo no se descarta la presencia de otras especies aún no identificadas.2012-01-072012-01-072012-01-07info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisapplication/pdfhttp://www.dspace.espol.edu.ec/handle/123456789/19351spainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositorio Escuela Superior Politécnica del Litoralinstname:Escuela Superior Politécnica del Litoralinstacron:ESPOL2012-01-07T14:14:34Zoai:www.dspace.espol.edu.ec:123456789/19351Institucionalhttps://www.dspace.espol.edu.ec/Universidad públicahttps://www.espol.edu.ec/.https://www.dspace.espol.edu.ec/oaiEcuador...opendoar:14792025-07-26T03:32:22.472688trueInstitucionalhttps://www.dspace.espol.edu.ec/Universidad públicahttps://www.espol.edu.ec/.https://www.dspace.espol.edu.ec/oai.Ecuador...opendoar:14792025-07-26T03:32:22.472688Repositorio Escuela Superior Politécnica del Litoral - Escuela Superior Politécnica del Litoraltrue
spellingShingle Diagnostico molecular de gemivirus en plantaciones comerciales de tomate (solanum lycopersicum l.) y malezas asociadas al cultivo, en la provincia Santa Elena
Ibarra Matamoros, María Alejandra
GEMINIVIRUS
BEGOMOVIRUS
TECNICAS MOLECULARES
TOMATE
status_str publishedVersion
title Diagnostico molecular de gemivirus en plantaciones comerciales de tomate (solanum lycopersicum l.) y malezas asociadas al cultivo, en la provincia Santa Elena
title_full Diagnostico molecular de gemivirus en plantaciones comerciales de tomate (solanum lycopersicum l.) y malezas asociadas al cultivo, en la provincia Santa Elena
title_fullStr Diagnostico molecular de gemivirus en plantaciones comerciales de tomate (solanum lycopersicum l.) y malezas asociadas al cultivo, en la provincia Santa Elena
title_full_unstemmed Diagnostico molecular de gemivirus en plantaciones comerciales de tomate (solanum lycopersicum l.) y malezas asociadas al cultivo, en la provincia Santa Elena
title_short Diagnostico molecular de gemivirus en plantaciones comerciales de tomate (solanum lycopersicum l.) y malezas asociadas al cultivo, en la provincia Santa Elena
title_sort Diagnostico molecular de gemivirus en plantaciones comerciales de tomate (solanum lycopersicum l.) y malezas asociadas al cultivo, en la provincia Santa Elena
topic GEMINIVIRUS
BEGOMOVIRUS
TECNICAS MOLECULARES
TOMATE
url http://www.dspace.espol.edu.ec/handle/123456789/19351