Análisis genómico y transcriptómico de cepas del género Acidithiobacillus implicadas en la biolixiviación de metales pesados

Este trabajo integró análisis genómicos y transcriptómicos de cepas de Acidithiobacillus con el objetivo de comprender los mecanismos moleculares que sostienen su capacidad de biolixiviar minerales metálicos. En primer lugar, el análisis genómico comparativo de A. ferrooxidans, A. thiooxidans, A. fe...

Szczegółowa specyfikacja

Zapisane w:
Opis bibliograficzny
1. autor: Pavón Catani, Alexis David (author)
Format: masterThesis
Wydane: 2025
Hasła przedmiotowe:
Dostęp online:https://repositorio.puce.edu.ec/handle/123456789/47881
Etykiety: Dodaj etykietę
Nie ma etykietki, Dołącz pierwszą etykiete!
_version_ 1859012733104553984
author Pavón Catani, Alexis David
author_facet Pavón Catani, Alexis David
author_role author
collection Repositorio Pontificia Universidad Católica del Ecuador
dc.contributor.none.fl_str_mv Cervantes Pérez, Sergio Alan
dc.creator.none.fl_str_mv Pavón Catani, Alexis David
dc.date.none.fl_str_mv 2025
2026-01-15T14:46:57Z
2026-01-15T14:46:57Z
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.identifier.none.fl_str_mv 15260
https://repositorio.puce.edu.ec/handle/123456789/47881
dc.language.none.fl_str_mv es
dc.publisher.none.fl_str_mv PUCE - Quito
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositorio Pontificia Universidad Católica del Ecuador
instname:Pontificia Universidad Católica del Ecuador
instacron:PUCE
dc.subject.none.fl_str_mv Acidithiobacillus - Genómica
Transcriptómica
Lixiviación bacteriana
Genómica comparada
Expresión génica
Hierro - Oxidación - Aspectos genéticos
dc.title.none.fl_str_mv Análisis genómico y transcriptómico de cepas del género Acidithiobacillus implicadas en la biolixiviación de metales pesados
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
info:eu-repo/semantics/masterThesis
description Este trabajo integró análisis genómicos y transcriptómicos de cepas de Acidithiobacillus con el objetivo de comprender los mecanismos moleculares que sostienen su capacidad de biolixiviar minerales metálicos. En primer lugar, el análisis genómico comparativo de A. ferrooxidans, A. thiooxidans, A. ferrivorans y A. caldus permitió identificar genes y operones clave implicados en rutas centrales de biolixiviación, como los asociados a la oxidación de hierro (rus operón, cyc2), a la oxidación de compuestos reducidos de azufre (sqr, sox, tetH), y a sistemas de tolerancia a metales pesados y condiciones extremas (copA, merA, arsC, entre otros). Estos hallazgos se enriquecieron mediante búsquedas de ortólogos con OrthoFinder, las cuales evidenciaron genes presentes en las cuatro especies, así como duplicaciones y ausencias específicas que sugieren trayectorias evolutivas divergentes y posibles adaptaciones ecológicas. Posteriormente, el análisis transcriptómico se enfocó en la comparación de la expresión génica bajo condiciones contrastantes, con especial énfasis en A. ferrivorans. Se observó regulación diferencial de genes clave en rutas de oxidación de azufre y hierro, mecanismos de estrés frente a pH extremadamente ácido y presencia de metales pesados, así como en la formación de biopelículas. Estos patrones sugieren adaptaciones moleculares que favorecen la eficiencia de la biolixiviación en distintos ambientes, particularmente en relación con la temperatura y disponibilidad de nutrientes. En conjunto, los resultados proporcionan un panorama integral: el análisis genómico define el repertorio de genes y su conservación evolutiva entre especies, mientras que el transcriptómico revela su activación diferencial frente a condiciones específicas. Esta doble aproximación contribuye al entendimiento del papel de Acidithiobacillus en la solubilización de metales y abre la posibilidad de diseñar estrategias más informadas para la optimización de procesos de biolixiviación. No obstante, se reconocen limitaciones asociadas al número de cepas estudiadas, la dependencia de datos públicos y la necesidad de validar experimentalmente los hallazgos. Futuras investigaciones podrán integrar otras aproximaciones ómicas (proteómica, metabolómica) para alcanzar una visión aún más completa del metabolismo y regulación de estas bacterias.
eu_rights_str_mv openAccess
format masterThesis
id PUCE_04f9df3fcaf53bc82de8fc7bddd849ad
identifier_str_mv 15260
instacron_str PUCE
institution PUCE
instname_str Pontificia Universidad Católica del Ecuador
language_invalid_str_mv es
network_acronym_str PUCE
network_name_str Repositorio Pontificia Universidad Católica del Ecuador
oai_identifier_str oai:repositorio.puce.edu.ec:123456789/47881
publishDate 2025
publisher.none.fl_str_mv PUCE - Quito
reponame_str Repositorio Pontificia Universidad Católica del Ecuador
repository.mail.fl_str_mv .
repository.name.fl_str_mv Repositorio Pontificia Universidad Católica del Ecuador - Pontificia Universidad Católica del Ecuador
repository_id_str 2180
spelling Análisis genómico y transcriptómico de cepas del género Acidithiobacillus implicadas en la biolixiviación de metales pesadosPavón Catani, Alexis DavidAcidithiobacillus - GenómicaTranscriptómicaLixiviación bacterianaGenómica comparadaExpresión génicaHierro - Oxidación - Aspectos genéticosEste trabajo integró análisis genómicos y transcriptómicos de cepas de Acidithiobacillus con el objetivo de comprender los mecanismos moleculares que sostienen su capacidad de biolixiviar minerales metálicos. En primer lugar, el análisis genómico comparativo de A. ferrooxidans, A. thiooxidans, A. ferrivorans y A. caldus permitió identificar genes y operones clave implicados en rutas centrales de biolixiviación, como los asociados a la oxidación de hierro (rus operón, cyc2), a la oxidación de compuestos reducidos de azufre (sqr, sox, tetH), y a sistemas de tolerancia a metales pesados y condiciones extremas (copA, merA, arsC, entre otros). Estos hallazgos se enriquecieron mediante búsquedas de ortólogos con OrthoFinder, las cuales evidenciaron genes presentes en las cuatro especies, así como duplicaciones y ausencias específicas que sugieren trayectorias evolutivas divergentes y posibles adaptaciones ecológicas. Posteriormente, el análisis transcriptómico se enfocó en la comparación de la expresión génica bajo condiciones contrastantes, con especial énfasis en A. ferrivorans. Se observó regulación diferencial de genes clave en rutas de oxidación de azufre y hierro, mecanismos de estrés frente a pH extremadamente ácido y presencia de metales pesados, así como en la formación de biopelículas. Estos patrones sugieren adaptaciones moleculares que favorecen la eficiencia de la biolixiviación en distintos ambientes, particularmente en relación con la temperatura y disponibilidad de nutrientes. En conjunto, los resultados proporcionan un panorama integral: el análisis genómico define el repertorio de genes y su conservación evolutiva entre especies, mientras que el transcriptómico revela su activación diferencial frente a condiciones específicas. Esta doble aproximación contribuye al entendimiento del papel de Acidithiobacillus en la solubilización de metales y abre la posibilidad de diseñar estrategias más informadas para la optimización de procesos de biolixiviación. No obstante, se reconocen limitaciones asociadas al número de cepas estudiadas, la dependencia de datos públicos y la necesidad de validar experimentalmente los hallazgos. Futuras investigaciones podrán integrar otras aproximaciones ómicas (proteómica, metabolómica) para alcanzar una visión aún más completa del metabolismo y regulación de estas bacterias.PUCE - QuitoCervantes Pérez, Sergio Alan2026-01-15T14:46:57Z2026-01-15T14:46:57Z2025info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdf15260https://repositorio.puce.edu.ec/handle/123456789/47881esinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositorio Pontificia Universidad Católica del Ecuadorinstname:Pontificia Universidad Católica del Ecuadorinstacron:PUCE2026-01-15T09:47:01Zoai:repositorio.puce.edu.ec:123456789/47881Institucionalhttp://repositorio.puce.edu.ec/Institución privadahttps://www.puce.edu.ec/http://repositorio.puce.edu.ec/oai.Ecuador...opendoar:21802026-01-15T09:47:01Repositorio Pontificia Universidad Católica del Ecuador - Pontificia Universidad Católica del Ecuadorfalse
spellingShingle Análisis genómico y transcriptómico de cepas del género Acidithiobacillus implicadas en la biolixiviación de metales pesados
Pavón Catani, Alexis David
Acidithiobacillus - Genómica
Transcriptómica
Lixiviación bacteriana
Genómica comparada
Expresión génica
Hierro - Oxidación - Aspectos genéticos
status_str publishedVersion
title Análisis genómico y transcriptómico de cepas del género Acidithiobacillus implicadas en la biolixiviación de metales pesados
title_full Análisis genómico y transcriptómico de cepas del género Acidithiobacillus implicadas en la biolixiviación de metales pesados
title_fullStr Análisis genómico y transcriptómico de cepas del género Acidithiobacillus implicadas en la biolixiviación de metales pesados
title_full_unstemmed Análisis genómico y transcriptómico de cepas del género Acidithiobacillus implicadas en la biolixiviación de metales pesados
title_short Análisis genómico y transcriptómico de cepas del género Acidithiobacillus implicadas en la biolixiviación de metales pesados
title_sort Análisis genómico y transcriptómico de cepas del género Acidithiobacillus implicadas en la biolixiviación de metales pesados
topic Acidithiobacillus - Genómica
Transcriptómica
Lixiviación bacteriana
Genómica comparada
Expresión génica
Hierro - Oxidación - Aspectos genéticos
url https://repositorio.puce.edu.ec/handle/123456789/47881