Análisis genómico de Drosophila guayllabambae (Diptera,Drosophilidae) considerada especie endémica del Ecuador utilizando biología computacional

El género Drosophila es un modelo clave para la genética evolutiva, particularmente en la región neotropical, que alberga una biodiversidad excepcional. Este estudio se centra en Drosophila guayllabambae(D. guayllabambae), una especie endémica de Ecuador perteneciente al grupo repleta. El ADN genómico fue secuenciado utilizando la tecnología de secuenciación Illumina, mediante la librería TruSeq DNA Nano y el secuenciador Illumina Hiseq, obteniéndose un ensamblaje del genoma de 160.42 Mb con 9,909 contigs mediante MaSuRCA. La evaluación con BUSCO reveló un 98.90% de ortólogos completos, lo que indica un ensamblaje robusto. Los análisis genómicos comparativos con D. mojavensis, D. melanogastery D. rucux destacaron tanto regiones conservadas como divergencias significativas, reflejando adaptaciones específicas a ambientes áridos y andinos. El genoma comprende 14,364 genes determinados por AUGUSTUS, 69,628 exones y 48,084 intrones, con un 20.06% de elementos transponibles (TEs)enmascarados por Repeat Masker. Estos hallazgos subrayan la importancia de D. guayllabambae como modelo para estudiar procesos evolutivos en especies neotropicales endémicas. Este estudio no solo proporciona un recurso genómico valioso para análisis comparativos, sino que también resalta la necesidad de investigar más a fondo los mecanismos ecológicos y evolutivos que impulsan la biodiversidad en la región. La integración de datos genómicos con estudios ecológicos mejorará las estrategias de conservación para especies endémicas frente a los desafíos ambientales.

• Hlavní autor: Villacís López, Keyla Monserrath (author)
• Médium: masterThesis
• Vydáno: 2025
• Témata: Genómica; Especie Endémica; Biología Computacional; Translocación (Genética)
• On-line přístup: https://repositorio.puce.edu.ec/handle/123456789/46274