Caracterización molecular de la bacteria Clavibacter michiganensis promotora del cáncer microbiano del tomate riñón (Lycopersicon esculentum mill), en el cantón Urcuquí
Los cultivos de tomate riñón (Lycopersicon esculentum Mill) se ven afectados por diversos agentes patógenos, resaltando entre ellos la bacteria Clavibacter michiganensis, la cual produce el cáncer bacteriano que causa efectos perjudiciales tanto en la cosecha como en los costos. Controlar los efecto...
Gorde:
| Egile nagusia: | |
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| Formatua: | bachelorThesis |
| Argitaratua: |
2019
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| Gaiak: | |
| Sarrera elektronikoa: | https://repositorio.puce.edu.ec/handle/123456789/39435 |
| Etiketak: |
Etiketa erantsi
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Etiketa erantsi | Gaia: | Los cultivos de tomate riñón (Lycopersicon esculentum Mill) se ven afectados por diversos agentes patógenos, resaltando entre ellos la bacteria Clavibacter michiganensis, la cual produce el cáncer bacteriano que causa efectos perjudiciales tanto en la cosecha como en los costos. Controlar los efectos de la mencionada bacteria requiere conocer específicamente la cepa que está actuando en el cultivo. Por tal motivo, el propósito general de este proyecto es caracterizar molecularmente la bacteria Clavibacter michiganensis promotora del cáncer bacteriano en tomate riñón (Lycopersicon esculentum Mill), en el cantón Urcuquí. El proceso de caracterización molecular se apoyó en los basamentos teóricos planteados por Mota (2008), Romero (2011), Dickinson (2003), Carbajal (2013), respecto a las técnicas fundamentales para llevar a cabo la caracterización molecular de una bacteria. Para lograr el objetivo mencionado previamente, se determinaron 13 puntos de muestreo, constituido por invernaderos dedicados al cultivo del tomate riñón, de los cuales solo dos no marcaron positivo. Posteriormente, se procedió a la extracción de ADN de las muestras infectadas usando el kit comercial PureLink® Genomic DNA Mini Kit (Invitrogen®), y fue enviado a Macrogen Korea Inc. para su respectiva secuenciación, identificando que la cepa causante de enfermedad de los cultivos, independientemente de la etapa fenológica en la que se encontraban pertenecen a la misma secuencia relativa más cercana: Clavibacter michiganensis subespecie michiganensis, con un porcentaje de identificación del 87,69 %, siendo de la clase bacteriana Actinobacteria. Luego se realizó un proceso electroforesis y se ratificó los resultados arrojados por la secuenciación de ADN, pues se obtuvo un promedio de 270 pares de bases (bp) aproximadamente, coincidiendo con lo señalado por Pastrik y Rainey (1999), en su estudio sobre las cinco subespecies de la bacteria Clavibacter michiganensis. |
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