Análisis computacional del microbioma del suelo en maní (Arachis hypogaea L.) en respuesta a la inoculación de Trichoderma harzianumITEM 3636
El cultivo de maní (Arachis hypogaeaL.) es crucial económica y nutricionalmente, pero su producción enfrenta desafíos. La inoculación con microorganismos beneficiosos como Trichoderma harzianumes una estrategia sostenible prometedora. Este estudio tuvo como objetivo evaluar, mediante análisis comput...
Gorde:
Egile nagusia: | |
---|---|
Formatua: | masterThesis |
Argitaratua: |
2025
|
Gaiak: | |
Sarrera elektronikoa: | https://repositorio.puce.edu.ec/handle/123456789/46247 |
Etiketak: |
Etiketa erantsi
Etiketarik gabe, Izan zaitez lehena erregistro honi etiketa jartzen!
|
_version_ | 1839356414862032896 |
---|---|
author | Alba Nepas, Jessica Maribel |
author_facet | Alba Nepas, Jessica Maribel |
author_role | author |
collection | Repositorio Pontificia Universidad Católica del Ecuador |
dc.contributor.none.fl_str_mv | Cervantes Pérez, Sergio Alan |
dc.creator.none.fl_str_mv | Alba Nepas, Jessica Maribel |
dc.date.none.fl_str_mv | 11/07/2025 11:27 11/07/2025 11:27 2025 |
dc.format.none.fl_str_mv | application/pdf |
dc.identifier.none.fl_str_mv | https://repositorio.puce.edu.ec/handle/123456789/46247 |
dc.language.none.fl_str_mv | es |
dc.publisher.none.fl_str_mv | PUCE - Quito |
dc.rights.none.fl_str_mv | info:eu-repo/semantics/openAccess |
dc.source.none.fl_str_mv | reponame:Repositorio Pontificia Universidad Católica del Ecuador instname:Pontificia Universidad Católica del Ecuador instacron:PUCE |
dc.subject.none.fl_str_mv | Microbiomas del suelo Arachis hypogaea Análisis computacional Plantas oleaginosas - Maní |
dc.title.none.fl_str_mv | Análisis computacional del microbioma del suelo en maní (Arachis hypogaea L.) en respuesta a la inoculación de Trichoderma harzianumITEM 3636 |
dc.type.none.fl_str_mv | info:eu-repo/semantics/publishedVersion info:eu-repo/semantics/masterThesis |
description | El cultivo de maní (Arachis hypogaeaL.) es crucial económica y nutricionalmente, pero su producción enfrenta desafíos. La inoculación con microorganismos beneficiosos como Trichoderma harzianumes una estrategia sostenible prometedora. Este estudio tuvo como objetivo evaluar, mediante análisis computacional, el impacto de la inoculación de T. harzianumITEM 3636 en la composición y funcionalidad del microbioma bacteriano del suelo en cultivos de maní, utilizando datos públicos de secuenciación del amplicón16S rRNA (Proyecto SRA: PRJNA471338) correspondientes a dos periodos (2014-15 y 2015-16) y tres condiciones: suelo inicial (CondicionIni), suelo con maní sin inocular (Tratamiento Control) y suelo con maní inoculado (Inoculación Tricho). Se aplicó un pipeline bioinformático en R (DADA2, phyloseq, vegan, micro eco) para control de calidad, inferencia de ASVs, asignación taxonómica (SILVA), análisis de diversidad alfa/beta y predicción funcional (FAPROTAX). Los resultados mostraron datos de alta calidad y profundidad de secuenciación adecuada. Se identificó un núcleo bacteriano estable (Gemmatimonas, Acidiferrimicrobium, Candidatus Solibacter, Sphingomonas) y una alta proporción de taxones raros. La diversidad alfa fue menor en la condición inicial, pero similar entre los tratamientos control e inoculación. La diversidad beta reveló diferencias significativas globales (PERMANOVA), pero el análisis RDA indicó que la variación temporal (Año) fue un factor más influyente que el tratamiento per seen la estructura comunitaria. Sin embargo, la inoculación conT. harzianumITEM 3636se asoció significativamente con un mayor potencial funcional inferido para ciclos clave de nitrógeno (oxidación de amonio, nitrificación) y azufre (respiración de sulfato/compuestos de azufre). Se concluye que, si bien T. harzianumI TEM 3636 no alteró drásticamente la estructura bacteriana dominante, sí moduló selectivamente el potencial funcional del microbioma, particularmente en vías relevantes para la disponibilidad de nutrientes |
eu_rights_str_mv | openAccess |
format | masterThesis |
id | PUCE_fc6ebe0d16abd28f1cc3be876a2ba82f |
instacron_str | PUCE |
institution | PUCE |
instname_str | Pontificia Universidad Católica del Ecuador |
language_invalid_str_mv | es |
network_acronym_str | PUCE |
network_name_str | Repositorio Pontificia Universidad Católica del Ecuador |
oai_identifier_str | oai:repositorio.puce.edu.ec:123456789/46247 |
publishDate | 2025 |
publisher.none.fl_str_mv | PUCE - Quito |
reponame_str | Repositorio Pontificia Universidad Católica del Ecuador |
repository.mail.fl_str_mv | . |
repository.name.fl_str_mv | Repositorio Pontificia Universidad Católica del Ecuador - Pontificia Universidad Católica del Ecuador |
repository_id_str | 2180 |
spelling | Análisis computacional del microbioma del suelo en maní (Arachis hypogaea L.) en respuesta a la inoculación de Trichoderma harzianumITEM 3636Alba Nepas, Jessica MaribelMicrobiomas del sueloArachis hypogaeaAnálisis computacionalPlantas oleaginosas - ManíEl cultivo de maní (Arachis hypogaeaL.) es crucial económica y nutricionalmente, pero su producción enfrenta desafíos. La inoculación con microorganismos beneficiosos como Trichoderma harzianumes una estrategia sostenible prometedora. Este estudio tuvo como objetivo evaluar, mediante análisis computacional, el impacto de la inoculación de T. harzianumITEM 3636 en la composición y funcionalidad del microbioma bacteriano del suelo en cultivos de maní, utilizando datos públicos de secuenciación del amplicón16S rRNA (Proyecto SRA: PRJNA471338) correspondientes a dos periodos (2014-15 y 2015-16) y tres condiciones: suelo inicial (CondicionIni), suelo con maní sin inocular (Tratamiento Control) y suelo con maní inoculado (Inoculación Tricho). Se aplicó un pipeline bioinformático en R (DADA2, phyloseq, vegan, micro eco) para control de calidad, inferencia de ASVs, asignación taxonómica (SILVA), análisis de diversidad alfa/beta y predicción funcional (FAPROTAX). Los resultados mostraron datos de alta calidad y profundidad de secuenciación adecuada. Se identificó un núcleo bacteriano estable (Gemmatimonas, Acidiferrimicrobium, Candidatus Solibacter, Sphingomonas) y una alta proporción de taxones raros. La diversidad alfa fue menor en la condición inicial, pero similar entre los tratamientos control e inoculación. La diversidad beta reveló diferencias significativas globales (PERMANOVA), pero el análisis RDA indicó que la variación temporal (Año) fue un factor más influyente que el tratamiento per seen la estructura comunitaria. Sin embargo, la inoculación conT. harzianumITEM 3636se asoció significativamente con un mayor potencial funcional inferido para ciclos clave de nitrógeno (oxidación de amonio, nitrificación) y azufre (respiración de sulfato/compuestos de azufre). Se concluye que, si bien T. harzianumI TEM 3636 no alteró drásticamente la estructura bacteriana dominante, sí moduló selectivamente el potencial funcional del microbioma, particularmente en vías relevantes para la disponibilidad de nutrientesPUCE - QuitoCervantes Pérez, Sergio Alan11/07/2025 11:2711/07/2025 11:272025info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://repositorio.puce.edu.ec/handle/123456789/46247esinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositorio Pontificia Universidad Católica del Ecuadorinstname:Pontificia Universidad Católica del Ecuadorinstacron:PUCE2025-07-31T12:28:58Zoai:repositorio.puce.edu.ec:123456789/46247Institucionalhttp://repositorio.puce.edu.ec/Institución privadahttps://www.puce.edu.ec/http://repositorio.puce.edu.ec/oai.Ecuador...opendoar:21802025-07-31T12:28:58Repositorio Pontificia Universidad Católica del Ecuador - Pontificia Universidad Católica del Ecuadorfalse |
spellingShingle | Análisis computacional del microbioma del suelo en maní (Arachis hypogaea L.) en respuesta a la inoculación de Trichoderma harzianumITEM 3636 Alba Nepas, Jessica Maribel Microbiomas del suelo Arachis hypogaea Análisis computacional Plantas oleaginosas - Maní |
status_str | publishedVersion |
title | Análisis computacional del microbioma del suelo en maní (Arachis hypogaea L.) en respuesta a la inoculación de Trichoderma harzianumITEM 3636 |
title_full | Análisis computacional del microbioma del suelo en maní (Arachis hypogaea L.) en respuesta a la inoculación de Trichoderma harzianumITEM 3636 |
title_fullStr | Análisis computacional del microbioma del suelo en maní (Arachis hypogaea L.) en respuesta a la inoculación de Trichoderma harzianumITEM 3636 |
title_full_unstemmed | Análisis computacional del microbioma del suelo en maní (Arachis hypogaea L.) en respuesta a la inoculación de Trichoderma harzianumITEM 3636 |
title_short | Análisis computacional del microbioma del suelo en maní (Arachis hypogaea L.) en respuesta a la inoculación de Trichoderma harzianumITEM 3636 |
title_sort | Análisis computacional del microbioma del suelo en maní (Arachis hypogaea L.) en respuesta a la inoculación de Trichoderma harzianumITEM 3636 |
topic | Microbiomas del suelo Arachis hypogaea Análisis computacional Plantas oleaginosas - Maní |
url | https://repositorio.puce.edu.ec/handle/123456789/46247 |