Caracterización filogenética y molecular de ‘Candidatus Liberibacter solanacearum’ en cuatro especies de la familia Solanáceae

El objetivo de este estudio fue caracterizar molecular y filogenéticamente a ‘Candidatus Liberibacter solanacearum’ (CLso) en cuatro especies de la familia Solanácea. En este sentido, plantas sintomáticas y asintomáticas de tomate de árbol, papa, pimiento y uvilla, y especímenes insectiles de Bactericera cockerelli fueron analizados mediante PCR convencional. Específicamente, muestras sintomáticas de tomate de árbol, papa, uvilla y B. cockerelli generaron amplicones aproximados de 1070 pb para el gen 16S rRNA y 669 pb para los genes ribosomales rplJ-rplL. Las muestras de pimiento mostraron resultados negativos para la detección de CLso. El análisis BLAST confirmó la presencia de la bacteria, encontrando una homología del 100 % con ‘Candidatus Liberibacter solanacearum’ (taxid: 556287). El análisis filogenético y el polimorfismo de un solo nucleótido (SNP) de las secuencias de los genes 16S rRNA y rplJ-rplL, identificaron al haplotipo A en todas las muestras positivas analizadas en este estudio, lo que sugiere su relación con los síntomas descritos en las especies vegetales sintomáticas y en B. cockerelli. Finalmente, CLso y B. cockerelli fueron detectados en siete provincias de la sierra ecuatoriana (Carchi, Imbabura, Pichincha, Cotopaxi, Tungurahua, Chimborazo y Bolívar), en temperaturas desde los 15 a 18 oC, y a una altitud desde 2400 a 3000 m.s.n.m., sugiriendo una buena adaptación de ambos a estas condiciones ambientales.

• Главный автор: Vallejo Borja, Marjorie Patricia (author)
• Формат: bachelorThesis
• Язык: spa
• Опубликовано: 2020
• Предметы: HAPLOTIPO A; TEMPERATURA; ALTITUD; CANDIDATUS LIBERIBACTER SOLANACEARUM
• Online-ссылка: http://www.dspace.uce.edu.ec/handle/25000/21454