Caracterización filogenética y molecular de ‘Candidatus Liberibacter solanacearum’ en cuatro especies de la familia Solanáceae

El objetivo de este estudio fue caracterizar molecular y filogenéticamente a ‘Candidatus Liberibacter solanacearum’ (CLso) en cuatro especies de la familia Solanácea. En este sentido, plantas sintomáticas y asintomáticas de tomate de árbol, papa, pimiento y uvilla, y especímenes insectiles de Bacter...

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Dades bibliogràfiques
Autor principal: Vallejo Borja, Marjorie Patricia (author)
Format: bachelorThesis
Idioma:spa
Publicat: 2020
Matèries:
Accés en línia:http://www.dspace.uce.edu.ec/handle/25000/21454
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Descripció
Sumari:El objetivo de este estudio fue caracterizar molecular y filogenéticamente a ‘Candidatus Liberibacter solanacearum’ (CLso) en cuatro especies de la familia Solanácea. En este sentido, plantas sintomáticas y asintomáticas de tomate de árbol, papa, pimiento y uvilla, y especímenes insectiles de Bactericera cockerelli fueron analizados mediante PCR convencional. Específicamente, muestras sintomáticas de tomate de árbol, papa, uvilla y B. cockerelli generaron amplicones aproximados de 1070 pb para el gen 16S rRNA y 669 pb para los genes ribosomales rplJ-rplL. Las muestras de pimiento mostraron resultados negativos para la detección de CLso. El análisis BLAST confirmó la presencia de la bacteria, encontrando una homología del 100 % con ‘Candidatus Liberibacter solanacearum’ (taxid: 556287). El análisis filogenético y el polimorfismo de un solo nucleótido (SNP) de las secuencias de los genes 16S rRNA y rplJ-rplL, identificaron al haplotipo A en todas las muestras positivas analizadas en este estudio, lo que sugiere su relación con los síntomas descritos en las especies vegetales sintomáticas y en B. cockerelli. Finalmente, CLso y B. cockerelli fueron detectados en siete provincias de la sierra ecuatoriana (Carchi, Imbabura, Pichincha, Cotopaxi, Tungurahua, Chimborazo y Bolívar), en temperaturas desde los 15 a 18 oC, y a una altitud desde 2400 a 3000 m.s.n.m., sugiriendo una buena adaptación de ambos a estas condiciones ambientales.