Estimación Bayesiana de la prevalencia real y propiedades diagnósticas (sensibilidad y especificidad) de 2 pruebas serológicas (RBT y SAT- EDTA) para el diagnóstico de Brucelosis bovina en Ecuador
El diagnóstico de la Brucelosis bovina se realiza regularmente a través de la aplicación de pruebas serológicas, por lo que en ausencia de una prueba perfecta (Gold standard), las decisiones de declaración del status sanitario de un individuo dependen de la prevalencia de la enfermedad y las caracte...
Gorde:
| Egile nagusia: | |
|---|---|
| Formatua: | masterThesis |
| Hizkuntza: | spa |
| Argitaratua: |
2019
|
| Gaiak: | |
| Sarrera elektronikoa: | http://www.dspace.uce.edu.ec/handle/25000/20221 |
| Etiketak: |
Etiketa erantsi
Etiketarik gabe, Izan zaitez lehena erregistro honi etiketa jartzen!
|
| _version_ | 1824209359947694080 |
|---|---|
| author | Paucar Quishpe, Adriana Valeria |
| author_facet | Paucar Quishpe, Adriana Valeria |
| author_role | author |
| collection | Repositorio de la Universidad Central del Ecuador |
| dc.contributor.none.fl_str_mv | Ron Garrido, Lenin Javier |
| dc.creator.none.fl_str_mv | Paucar Quishpe, Adriana Valeria |
| dc.date.none.fl_str_mv | 2019-12-13T02:11:56Z 2019-12-13T02:11:56Z 2019 |
| dc.format.none.fl_str_mv | application/pdf |
| dc.identifier.none.fl_str_mv | Paucar Quishpe, A. (2019). Estimación Bayesiana de la prevalencia real y propiedades diagnósticas (sensibilidad y especificidad) de 2 pruebas serológicas (RBT y SAT- EDTA) para el diagnóstico de Brucelosis bovina en Ecuador. Trabajo de titulación previo a la obtención del Título de Magister en Epidemiología y Salud Pública Veterinaria. Instituto Superior de Investigación y Posgrado. Quito: UCE. 145 p. BIBLIOTECA GENERAL - MEDICINA VETERINARIA http://www.dspace.uce.edu.ec/handle/25000/20221 |
| dc.language.none.fl_str_mv | spa |
| dc.publisher.none.fl_str_mv | Quito: UCE |
| dc.rights.none.fl_str_mv | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/ec/ info:eu-repo/semantics/openAccess |
| dc.source.none.fl_str_mv | reponame:Repositorio de la Universidad Central del Ecuador instname:Universidad Central del Ecuador instacron:UCE |
| dc.subject.none.fl_str_mv | MODELO BAYESIANO BRUCELOSIS PRUEBAS DE DIAGNÓSTICO SENSIBILIDAD |
| dc.title.none.fl_str_mv | Estimación Bayesiana de la prevalencia real y propiedades diagnósticas (sensibilidad y especificidad) de 2 pruebas serológicas (RBT y SAT- EDTA) para el diagnóstico de Brucelosis bovina en Ecuador |
| dc.type.none.fl_str_mv | info:eu-repo/semantics/publishedVersion info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| description | El diagnóstico de la Brucelosis bovina se realiza regularmente a través de la aplicación de pruebas serológicas, por lo que en ausencia de una prueba perfecta (Gold standard), las decisiones de declaración del status sanitario de un individuo dependen de la prevalencia de la enfermedad y las características de las pruebas usadas (Sensibilidad y Especificidad). El Ecuador desde el año 2008 cuenta con el Programa Nacional para el control de Brucelosis; mismo que ha contribuido a reducir la prevalencia de la enfermedad, sin embargo, dada la no obligatoriedad de su implementación y los altos costos que deben afrontar los propietarios para el diagnóstico de la enfermedad, ha hecho que los pequeños y medianos productores ganaderos (que son más de 80% de los productores) no se involucren en el mismo. Sobre esta base, la presente investigación tuvo como objetivo principal determinar la prevalencia aparente y real de la brucelosis bovina en hatos de pequeños y medianos productores, y las características diagnósticas (Sensibilidad y Especificidad) de las pruebas serológicas RB y SAT-EDTA (Punto de Corte: 30 UI) utilizando un enfoque bayesiano. Entre el año 2011 al 2016, 2733 hatos fueron visitados y 22592 animales fueron muestreados en 19 provincias del Ecuador continental. Las pruebas de screening RB y SAT fueron aplicadas a cada muestra sanguínea y sus resultados fueron clasificados como positivo o negativo, dando 4 categorías de clasificación para los animales. Dos marcos Bayesianos similares fueron utilizados para el análisis: uno basado en probabilidades condicionales y otro en covarianzas para los resultados de individuos realmente enfermos y sanos. Los estadísticos Bayes-p, DIC y BGR se utilizaron para la selección de mejores modelos y espacios a muestrear. La prevalencia real a nivel de hato se estimó usando el equivalente a pooles de granja (pooling testing). A nivel de hatos la seroprevalencia nacional fue de 7.9% IC95%(6.79 – 9.03%) y la prevalencia real de 12.2% I.C.95% (7.8 – 17.9%). La prevalencia aparente en los animales a nivel nacional fue estimada en 2.2% IC95%(1.82 – 2.67%) utilizando una interpretación en paralelo. Las estimaciones bayesianas de la prevalencia real en animales dieron resultados 1.6% ICr95% (1.0%-2.4%). Similarmente la Sensibilidad de la Prueba diagnóstica RB fue estimada en 64.6% ICr95% (42.9%-84.5%) y su especificidad de 98.9% ICr95% (98.6%-99.0%). Para la prueba SAT-EDTA las estimaciones fueron de 64.0% ICr95% (41.9%-85.9%) para la Sensibilidad y 98.9% ICr95% (98.6%-99.1%) para la Especificidad. Los resultados de las dos pruebas están altamente correlacionados cuando se las valora en individuos infectados y se presentan una baja correlación cuando los individuos están sanos. Así mismo, se observó una alta variación espacial, siendo la región Costa la que más alta prevalencia real de brucelosis presentó con un 2.5% ICr95%(1.3%-3.8%) a nivel de animales y 28.2% I.Cr.95% (15.7 – 39.8%) a nivel de hatos. Los resultados de este estudio deben guiar a las autoridades sanitarias para la toma decisiones en los programas de erradicación de la enfermedad y los resultados individuales deben ser valorados sobre los valores predictivos positivos y negativos de los resultados. |
| eu_rights_str_mv | openAccess |
| format | masterThesis |
| id | UCE_a6dbda5f203af36e098f43788bf45f57 |
| identifier_str_mv | Paucar Quishpe, A. (2019). Estimación Bayesiana de la prevalencia real y propiedades diagnósticas (sensibilidad y especificidad) de 2 pruebas serológicas (RBT y SAT- EDTA) para el diagnóstico de Brucelosis bovina en Ecuador. Trabajo de titulación previo a la obtención del Título de Magister en Epidemiología y Salud Pública Veterinaria. Instituto Superior de Investigación y Posgrado. Quito: UCE. 145 p. BIBLIOTECA GENERAL - MEDICINA VETERINARIA |
| instacron_str | UCE |
| institution | UCE |
| instname_str | Universidad Central del Ecuador |
| language | spa |
| network_acronym_str | UCE |
| network_name_str | Repositorio de la Universidad Central del Ecuador |
| oai_identifier_str | oai:dspace.uce.edu.ec:25000/20221 |
| publishDate | 2019 |
| publisher.none.fl_str_mv | Quito: UCE |
| reponame_str | Repositorio de la Universidad Central del Ecuador |
| repository.mail.fl_str_mv | . |
| repository.name.fl_str_mv | Repositorio de la Universidad Central del Ecuador - Universidad Central del Ecuador |
| repository_id_str | 2487 |
| rights_invalid_str_mv | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/ec/ |
| spelling | Estimación Bayesiana de la prevalencia real y propiedades diagnósticas (sensibilidad y especificidad) de 2 pruebas serológicas (RBT y SAT- EDTA) para el diagnóstico de Brucelosis bovina en EcuadorPaucar Quishpe, Adriana ValeriaMODELO BAYESIANOBRUCELOSISPRUEBAS DE DIAGNÓSTICOSENSIBILIDADEl diagnóstico de la Brucelosis bovina se realiza regularmente a través de la aplicación de pruebas serológicas, por lo que en ausencia de una prueba perfecta (Gold standard), las decisiones de declaración del status sanitario de un individuo dependen de la prevalencia de la enfermedad y las características de las pruebas usadas (Sensibilidad y Especificidad). El Ecuador desde el año 2008 cuenta con el Programa Nacional para el control de Brucelosis; mismo que ha contribuido a reducir la prevalencia de la enfermedad, sin embargo, dada la no obligatoriedad de su implementación y los altos costos que deben afrontar los propietarios para el diagnóstico de la enfermedad, ha hecho que los pequeños y medianos productores ganaderos (que son más de 80% de los productores) no se involucren en el mismo. Sobre esta base, la presente investigación tuvo como objetivo principal determinar la prevalencia aparente y real de la brucelosis bovina en hatos de pequeños y medianos productores, y las características diagnósticas (Sensibilidad y Especificidad) de las pruebas serológicas RB y SAT-EDTA (Punto de Corte: 30 UI) utilizando un enfoque bayesiano. Entre el año 2011 al 2016, 2733 hatos fueron visitados y 22592 animales fueron muestreados en 19 provincias del Ecuador continental. Las pruebas de screening RB y SAT fueron aplicadas a cada muestra sanguínea y sus resultados fueron clasificados como positivo o negativo, dando 4 categorías de clasificación para los animales. Dos marcos Bayesianos similares fueron utilizados para el análisis: uno basado en probabilidades condicionales y otro en covarianzas para los resultados de individuos realmente enfermos y sanos. Los estadísticos Bayes-p, DIC y BGR se utilizaron para la selección de mejores modelos y espacios a muestrear. La prevalencia real a nivel de hato se estimó usando el equivalente a pooles de granja (pooling testing). A nivel de hatos la seroprevalencia nacional fue de 7.9% IC95%(6.79 – 9.03%) y la prevalencia real de 12.2% I.C.95% (7.8 – 17.9%). La prevalencia aparente en los animales a nivel nacional fue estimada en 2.2% IC95%(1.82 – 2.67%) utilizando una interpretación en paralelo. Las estimaciones bayesianas de la prevalencia real en animales dieron resultados 1.6% ICr95% (1.0%-2.4%). Similarmente la Sensibilidad de la Prueba diagnóstica RB fue estimada en 64.6% ICr95% (42.9%-84.5%) y su especificidad de 98.9% ICr95% (98.6%-99.0%). Para la prueba SAT-EDTA las estimaciones fueron de 64.0% ICr95% (41.9%-85.9%) para la Sensibilidad y 98.9% ICr95% (98.6%-99.1%) para la Especificidad. Los resultados de las dos pruebas están altamente correlacionados cuando se las valora en individuos infectados y se presentan una baja correlación cuando los individuos están sanos. Así mismo, se observó una alta variación espacial, siendo la región Costa la que más alta prevalencia real de brucelosis presentó con un 2.5% ICr95%(1.3%-3.8%) a nivel de animales y 28.2% I.Cr.95% (15.7 – 39.8%) a nivel de hatos. Los resultados de este estudio deben guiar a las autoridades sanitarias para la toma decisiones en los programas de erradicación de la enfermedad y los resultados individuales deben ser valorados sobre los valores predictivos positivos y negativos de los resultados.The diagnosis of bovine brucellosis usually is evaluated through the application of serological tests, so that in the absence of a perfect test (gold standard), decisions to declare the health status of an individual depend on the prevalence of the disease and the characteristics of the tests used (Sensitivity and Specificity). Ecuador since 2008 has had the National Program for the control of Brucellosis; which has contributed to reducing the prevalence of the disease, however, given the non-mandatory implementation and the high costs that owners must face for the diagnosis of the disease, small or medium livestock holders (which are more than 80% of the producers) are not set involved on it. On this basis, the present investigation had as main objective to determine the apparent and real prevalence of bovine brucellosis in herds of small and medium producers, and to determinate diagnostic characteristics (Sensitivity and Specificity) of the RB and SAT-EDTA (Cut-off: 30 UI) serological tests using an approach Bayesian. Between 2011 and 2016, 2733 herds were visited and 22592 animals were sampled in 19 provinces continental part of Ecuador. The RB and SAT screening tests were applied to each blood sample and their results were classified as positive or negative, giving 4 classification categories for the animals. Two similar Bayesian frameworks were used for the analysis: one based on conditional probabilities and another on covariances for the results of really sick and healthy individuals. The Bayes-p, DIC and BGR statistics were used to select better models and spaces to be sampled. Real prevalence at the herd level was estimated using the equivalent to farm pools (pooling testing). At the herd level the national seroprevalence was 7.9% C.I.95% (6.79 - 9.03%) and the real prevalence of 12.2% C.I.95% (7.8 - 17.9%). The apparent prevalence in animals nationwide was estimated at 2.2% C.I.95% (1.82 - 2.67%) using a parallel interpretation. Bayesian estimates of the real prevalence in animals gave results 1.6% Cr.I.95% (1.0% -2.4%). Similarly, the Sensitivity of the RB Diagnostic Test was estimated at 64.6% Cr.I.95% (42.9% -84.5%) and its specificity of 98.9% Cr.I.95% (98.6% -99.0%). For the SAT-EDTA test, estimates were 64.0% Cr.I.95% (41.9% -85.9%) for Sensitivity and 98.9% Cr.I.95% (98.6% -99.1%) for Specificity. The results of the two tests are highly correlated when they are evaluated in infected individuals and they show a low correlation when the individuals are healthy. Likewise, a high spatial variation was observed, with the Costa region having the highest real prevalence of brucellosis with 2.5% Cr.I.95% (1.3% -3.8%) at the animal level and 28.2% Cr.I.95% (15.7 - 39.8%) at herd level. The results of this study should guide health authorities to make decisions in disease eradication programs and individual results should be assessed on the positive and negative predictive values of the results.Quito: UCERon Garrido, Lenin Javier2019-12-13T02:11:56Z2019-12-13T02:11:56Z2019info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfPaucar Quishpe, A. (2019). Estimación Bayesiana de la prevalencia real y propiedades diagnósticas (sensibilidad y especificidad) de 2 pruebas serológicas (RBT y SAT- EDTA) para el diagnóstico de Brucelosis bovina en Ecuador. Trabajo de titulación previo a la obtención del Título de Magister en Epidemiología y Salud Pública Veterinaria. Instituto Superior de Investigación y Posgrado. Quito: UCE. 145 p.BIBLIOTECA GENERAL - MEDICINA VETERINARIAhttp://www.dspace.uce.edu.ec/handle/25000/20221spahttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/ec/info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositorio de la Universidad Central del Ecuadorinstname:Universidad Central del Ecuadorinstacron:UCE2024-12-12T08:20:57Zoai:dspace.uce.edu.ec:25000/20221Institucionalhttp://www.dspace.uce.edu.ec/Universidad públicahttps://www.uce.edu.ec/http://www.dspace.uce.edu.ec/oai.Ecuador...opendoar:24872024-12-12T08:20:57Repositorio de la Universidad Central del Ecuador - Universidad Central del Ecuadorfalse |
| spellingShingle | Estimación Bayesiana de la prevalencia real y propiedades diagnósticas (sensibilidad y especificidad) de 2 pruebas serológicas (RBT y SAT- EDTA) para el diagnóstico de Brucelosis bovina en Ecuador Paucar Quishpe, Adriana Valeria MODELO BAYESIANO BRUCELOSIS PRUEBAS DE DIAGNÓSTICO SENSIBILIDAD |
| status_str | publishedVersion |
| title | Estimación Bayesiana de la prevalencia real y propiedades diagnósticas (sensibilidad y especificidad) de 2 pruebas serológicas (RBT y SAT- EDTA) para el diagnóstico de Brucelosis bovina en Ecuador |
| title_full | Estimación Bayesiana de la prevalencia real y propiedades diagnósticas (sensibilidad y especificidad) de 2 pruebas serológicas (RBT y SAT- EDTA) para el diagnóstico de Brucelosis bovina en Ecuador |
| title_fullStr | Estimación Bayesiana de la prevalencia real y propiedades diagnósticas (sensibilidad y especificidad) de 2 pruebas serológicas (RBT y SAT- EDTA) para el diagnóstico de Brucelosis bovina en Ecuador |
| title_full_unstemmed | Estimación Bayesiana de la prevalencia real y propiedades diagnósticas (sensibilidad y especificidad) de 2 pruebas serológicas (RBT y SAT- EDTA) para el diagnóstico de Brucelosis bovina en Ecuador |
| title_short | Estimación Bayesiana de la prevalencia real y propiedades diagnósticas (sensibilidad y especificidad) de 2 pruebas serológicas (RBT y SAT- EDTA) para el diagnóstico de Brucelosis bovina en Ecuador |
| title_sort | Estimación Bayesiana de la prevalencia real y propiedades diagnósticas (sensibilidad y especificidad) de 2 pruebas serológicas (RBT y SAT- EDTA) para el diagnóstico de Brucelosis bovina en Ecuador |
| topic | MODELO BAYESIANO BRUCELOSIS PRUEBAS DE DIAGNÓSTICO SENSIBILIDAD |
| url | http://www.dspace.uce.edu.ec/handle/25000/20221 |