Caracterización morfo-cultural e identificación molecular de comunidades bacterianas de la cuenca hidrográfica El Carmen- Loja

Microbasins are ecosystems of great environmental importance due to their huge biological diversity, landscape and cultural value and primarily due to their ability to store the liquid of live: water. Today efforts to direct studies that contribute to the knowledge of the biological communities that...

Πλήρης περιγραφή

Αποθηκεύτηκε σε:
Λεπτομέρειες βιβλιογραφικής εγγραφής
Κύριος συγγραφέας: Rodríguez Díaz, Evelyng Gardenia (author)
Μορφή: bachelorThesis
Γλώσσα:spa
Έκδοση: 2016
Θέματα:
Διαθέσιμο Online:http://dspace.unl.edu.ec/jspui/handle/123456789/9902
Ετικέτες: Προσθήκη ετικέτας
Δεν υπάρχουν, Καταχωρήστε ετικέτα πρώτοι!
_version_ 1857832958468030464
author Rodríguez Díaz, Evelyng Gardenia
author_facet Rodríguez Díaz, Evelyng Gardenia
author_role author
collection Repositorio Universidad Nacional de Loja
dc.contributor.none.fl_str_mv Torres Gutiérrez, Roldán
dc.creator.none.fl_str_mv Rodríguez Díaz, Evelyng Gardenia
dc.date.none.fl_str_mv 2016-04-06T16:52:00Z
2016-04-06T16:52:00Z
2016
dc.format.none.fl_str_mv 77 p.
application/pdf
dc.identifier.none.fl_str_mv http://dspace.unl.edu.ec/jspui/handle/123456789/9902
dc.language.none.fl_str_mv spa
dc.publisher.none.fl_str_mv Loja: Universidad Nacional de Loja
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositorio Universidad Nacional de Loja
instname:Universidad Nacional de Loja
instacron:UNL
dc.subject.none.fl_str_mv COMUNIDADES BACTERIANAS
CONTAMINACIÓN DEL AGUA
IDENTIFICACIÓN MOLECULAR
dc.title.none.fl_str_mv Caracterización morfo-cultural e identificación molecular de comunidades bacterianas de la cuenca hidrográfica El Carmen- Loja
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
info:eu-repo/semantics/bachelorThesis
description Microbasins are ecosystems of great environmental importance due to their huge biological diversity, landscape and cultural value and primarily due to their ability to store the liquid of live: water. Today efforts to direct studies that contribute to the knowledge of the biological communities that inhabit these types of ecosystems are redoubled. That is why this research aimed to characterize and compare bacterial communities in water and sediments samples of the microbasin "El Carmen" Loja, taking into account climatic variables and vegetation of the study area during the rainy season. Our study based on a diagnosis of environmental variables that are closely related to the proliferation of bacterial communities such as temperature, precipitation and riparian vegetation. Subsequently, quantification, morpho-cultural characterization and molecular identification of bacterial isolates from water and sediment was performed. The results show that there was a marked influence of environmental variables evaluated on the quantification and diversity of analysed microorganisms. However, it could be determined that the Rivera Quality Index (RQI) is taken as "Good", because all measured attributes were optimal. Analysing the quantification of bacterial communities’ reveals that exists in most of the samples a tendency to standardize the growth curve in the evaluated period except ESP2 B and ESP3 B for water and ESP1 B for sediment. The comparison between the two ravine, regarding Colonies Former Unit (CFU ml-1) in water samples, showed that in the Espumos ravine there is a 7.7% increase over El Carmen; whereas for sediment El Carmen beat Espumos in 31.1% of bacterial CFU g-1. Through morpho-cultural characterization it was determined that the most abundant appearance between bacterial communities was bearded, with a circular shape, convex elevation and flat or crushed, continuous whole edge, beige colour and Gram positive and Gram negative short rods. All these characteristics correspond to those genera belonging to Bacillus and Micrococcus. Molecular methods allowed the genomic DNA extraction and amplification of 16S rRNA gene for bacteria genetic identification at the species level; however, this activity could not be performed due to genomic sequencing couldn´t be performed   
eu_rights_str_mv openAccess
format bachelorThesis
id UNL_2a5f388e4e5b24e8f9c7b1b9aa49cb9b
instacron_str UNL
institution UNL
instname_str Universidad Nacional de Loja
language spa
network_acronym_str UNL
network_name_str Repositorio Universidad Nacional de Loja
oai_identifier_str oai:dspace.unl.edu.ec:123456789/9902
publishDate 2016
publisher.none.fl_str_mv Loja: Universidad Nacional de Loja
reponame_str Repositorio Universidad Nacional de Loja
repository.mail.fl_str_mv *
repository.name.fl_str_mv Repositorio Universidad Nacional de Loja - Universidad Nacional de Loja
repository_id_str 0
spelling Caracterización morfo-cultural e identificación molecular de comunidades bacterianas de la cuenca hidrográfica El Carmen- LojaRodríguez Díaz, Evelyng GardeniaCOMUNIDADES BACTERIANASCONTAMINACIÓN DEL AGUAIDENTIFICACIÓN MOLECULARMicrobasins are ecosystems of great environmental importance due to their huge biological diversity, landscape and cultural value and primarily due to their ability to store the liquid of live: water. Today efforts to direct studies that contribute to the knowledge of the biological communities that inhabit these types of ecosystems are redoubled. That is why this research aimed to characterize and compare bacterial communities in water and sediments samples of the microbasin "El Carmen" Loja, taking into account climatic variables and vegetation of the study area during the rainy season. Our study based on a diagnosis of environmental variables that are closely related to the proliferation of bacterial communities such as temperature, precipitation and riparian vegetation. Subsequently, quantification, morpho-cultural characterization and molecular identification of bacterial isolates from water and sediment was performed. The results show that there was a marked influence of environmental variables evaluated on the quantification and diversity of analysed microorganisms. However, it could be determined that the Rivera Quality Index (RQI) is taken as "Good", because all measured attributes were optimal. Analysing the quantification of bacterial communities’ reveals that exists in most of the samples a tendency to standardize the growth curve in the evaluated period except ESP2 B and ESP3 B for water and ESP1 B for sediment. The comparison between the two ravine, regarding Colonies Former Unit (CFU ml-1) in water samples, showed that in the Espumos ravine there is a 7.7% increase over El Carmen; whereas for sediment El Carmen beat Espumos in 31.1% of bacterial CFU g-1. Through morpho-cultural characterization it was determined that the most abundant appearance between bacterial communities was bearded, with a circular shape, convex elevation and flat or crushed, continuous whole edge, beige colour and Gram positive and Gram negative short rods. All these characteristics correspond to those genera belonging to Bacillus and Micrococcus. Molecular methods allowed the genomic DNA extraction and amplification of 16S rRNA gene for bacteria genetic identification at the species level; however, this activity could not be performed due to genomic sequencing couldn´t be performed   Las microcuencas son ecosistemas de gran importancia ambiental por su gran diversidad biológica, paisajística, cultural y prioritariamente por su capacidad de almacenar el líquido de la vida: el agua. Hoy día se redoblan esfuerzos para encaminar estudios que contribuyan al conocimiento de las comunidades biológicas que habitan estos tipos de ecosistemas. Es por ello que la presente investigación tuvo como objetivos caracterizar y comparar comunidades bacterianas en muestras de agua y sedimentos de la microcuenca “El Carmen” del Cantón Loja, fuente abastecedora de agua para la población lojana; teniendo en cuenta variables climatológicas y de vegetación de la zona de estudio en época lluviosa. Este estudio partió de un diagnóstico de varibles ambientales que se encuentran estrechamente relacionadas a la proliferacion de comunidades bacterianas, tales como: temperatura, precipitación y vegetación riparia. Posteriormente se realizó la cuantificacion, caracterización morfo-cultural e identificación molecular de los aislados procedentes de aguas y sedimentos. Los resultados obtenidos ponen de manifiesto que no hubo una marcada influencia de las variables ambientales evaluadas sobre la cuantificación y diversidad de microorganismos analizados. Sin embargo, pudo determinarse que Índice de Calidad de las Riveras (RQI) se catalaogó como “Bueno”, debido a que todos los atributos medidos fueron óptimos. El análisis de la cuantificación de las comunidades bacterianas arrojó que en la mayoría de las muestras existe una tendencia a la estandarización de la curva de crecimiento en los periodos evaluados, con excepción de ESP2 B y ESP3 B para agua y ESP1 B para sedimentos. La comparación entre ambas quebradas respecto a las UFC ml-1 en las muestras de agua, demostró que en la quebrada Espumos existe un 7.7% de incremento con respecto al quebrada El Carmen; mientras que para sedimento la quebrada El Carmen superó a Espumos en 31.1% de UFC g-1 bacterianas. Mediante la caracterización morfocultural se pudo determinar que la apariencia más abudante entre las comunidades bacterianas fue barbada, la forma circular, elevación convexa y plana o aplastada, borde entero continuo, color beige y tinción de Gram cocos Gram positivos y bacilos cortos gram negativos. Todas estas características se corresponden con las pertenecientes a los géneros Bacillus y Micrococcus. Los métodos moleculares permitieron la extracción de ADN genómico y la amplificación del gen 16S rRNA para la identificación a nivel de especies de las bacterias aisladas; sin embargo, esta actividad no pudo realizarse a cabalidad debido a que no pudo realizarse la secuenciación genómica.Loja: Universidad Nacional de LojaTorres Gutiérrez, Roldán2016-04-06T16:52:00Z2016-04-06T16:52:00Z2016info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesis77 p.application/pdfhttp://dspace.unl.edu.ec/jspui/handle/123456789/9902spainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositorio Universidad Nacional de Lojainstname:Universidad Nacional de Lojainstacron:UNL2025-05-02T13:49:14Zoai:dspace.unl.edu.ec:123456789/9902Institucionalhttps://dspace.unl.edu.ec/Universidad públicahttps://unl.edu.ec/https://dspace.unl.edu.ec/oaiEcuador***opendoar:02025-05-02T13:49:14falseInstitucionalhttps://dspace.unl.edu.ec/Universidad públicahttps://unl.edu.ec/https://dspace.unl.edu.ec/oai*Ecuador***opendoar:02025-05-02T13:49:14Repositorio Universidad Nacional de Loja - Universidad Nacional de Lojafalse
spellingShingle Caracterización morfo-cultural e identificación molecular de comunidades bacterianas de la cuenca hidrográfica El Carmen- Loja
Rodríguez Díaz, Evelyng Gardenia
COMUNIDADES BACTERIANAS
CONTAMINACIÓN DEL AGUA
IDENTIFICACIÓN MOLECULAR
status_str publishedVersion
title Caracterización morfo-cultural e identificación molecular de comunidades bacterianas de la cuenca hidrográfica El Carmen- Loja
title_full Caracterización morfo-cultural e identificación molecular de comunidades bacterianas de la cuenca hidrográfica El Carmen- Loja
title_fullStr Caracterización morfo-cultural e identificación molecular de comunidades bacterianas de la cuenca hidrográfica El Carmen- Loja
title_full_unstemmed Caracterización morfo-cultural e identificación molecular de comunidades bacterianas de la cuenca hidrográfica El Carmen- Loja
title_short Caracterización morfo-cultural e identificación molecular de comunidades bacterianas de la cuenca hidrográfica El Carmen- Loja
title_sort Caracterización morfo-cultural e identificación molecular de comunidades bacterianas de la cuenca hidrográfica El Carmen- Loja
topic COMUNIDADES BACTERIANAS
CONTAMINACIÓN DEL AGUA
IDENTIFICACIÓN MOLECULAR
url http://dspace.unl.edu.ec/jspui/handle/123456789/9902