Estandarización de un protocolo para la rápida detección del Gen Bla-KPC en Bacterias Gramnegativas resistentes a Carbapenémicos mediante el uso de LAMP (Loop Mediated Isothermal Amplification)

En Ecuador existe gran prevalencia de bacterias portadoras de enzimas carbapenemasas que representan el principal mecanismo de resistencia frente a los antibióticos betalactámicos, utilizados en el tratamiento de infecciones respiratorias, del sistema nervioso central, intraabdominales, urinarias, e...

Descrición completa

Gardado en:

Detalles Bibliográficos
Autor Principal:	Alejandro Paspuezan, Ronny Ricardo (author)
Formato:	bachelorThesis
Idioma:	spa
Publicado:	2019
Subjects:	BIOTECNOLOGÍA DE LOS RECURSOS NATURALES CARBAPENEMASAS ISOTÉRMICO PIROFOSFATO
Acceso en liña:	https://dspace.ups.edu.ec/handle/123456789/16949
Tags:	Engadir etiqueta Sen Etiquetas, Sexa o primeiro en etiquetar este rexistro!

_version_	1858988313902317568
author	Alejandro Paspuezan, Ronny Ricardo
author_facet	Alejandro Paspuezan, Ronny Ricardo
author_role	author
collection	Repositorio Universidad Politécnica Salesiana
dc.contributor.none.fl_str_mv	Karolys Gutiérrez, Germania Margarita
dc.creator.none.fl_str_mv	Alejandro Paspuezan, Ronny Ricardo
dc.date.none.fl_str_mv	2019-02-27T21:57:42Z 2019-02-27T21:57:42Z 2019-02
dc.format.none.fl_str_mv	application/pdf
dc.identifier.none.fl_str_mv	https://dspace.ups.edu.ec/handle/123456789/16949
dc.language.none.fl_str_mv	spa
dc.rights.none.fl_str_mv	Atribución-NoComercial-SinDerivadas 3.0 Ecuador http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/ec/ info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.source.none.fl_str_mv	reponame:Repositorio Universidad Politécnica Salesiana instname:Universidad Politécnica Salesiana instacron:UPS
dc.subject.none.fl_str_mv	BIOTECNOLOGÍA DE LOS RECURSOS NATURALES CARBAPENEMASAS ISOTÉRMICO PIROFOSFATO
dc.title.none.fl_str_mv	Estandarización de un protocolo para la rápida detección del Gen Bla-KPC en Bacterias Gramnegativas resistentes a Carbapenémicos mediante el uso de LAMP (Loop Mediated Isothermal Amplification)
dc.type.none.fl_str_mv	info:eu-repo/semantics/publishedVersion info:eu-repo/semantics/bachelorThesis
description	En Ecuador existe gran prevalencia de bacterias portadoras de enzimas carbapenemasas que representan el principal mecanismo de resistencia frente a los antibióticos betalactámicos, utilizados en el tratamiento de infecciones respiratorias, del sistema nervioso central, intraabdominales, urinarias, endocarditis y sepsis de origen no clasificado. El gen codificante para carbapenemasas, bla-KPC-2, es el de mayor incidencia en instituciones de salud del país, según reportes del INSPI – CZ9, Centro de Referencia Nacional de Resistencia a los Antimicrobianos (CNR-RAM). Actualmente hospitales o centros de salud básicos carecen de una técnica de amplificación de ácidos nucleicos de bajo costo, rápida detección, alta sensibilidad, especificidad y capacidad para discriminar secuencias de genes de resistencia. Mediante esta investigación se estandarizó un protocolo para la rápida detección del gen bla-KPC en Enterobacterias, usando LAMP como técnica de diagnóstico clínico que pueda ser utilizada a futuro en hospitales y centros de salud básicos. Se seleccionaron del cepario del CNR-RAM, 40 cepas bacterianas: 20 positivas para bla-KPC; 11 cepas con diferentes genes de resistencia a carbapenémicos (BLEE; bla-IMP; bla-NDM; bla-OXA-48, bla-Ctx-m) y 9 que no presentaban ningún gen de resistencia, todas confirmadas previamente mediante microbiología y biología molecular. Las condiciones de amplificación de la región del gen bla-KPC, que permitieron obtener un amplicón de buena calidad fueron: temperatura a 63 °C, concentraciones de oligonucleótidos internos: FIP/BIP 0.4μM; MgSO4 desde 4mM; Betaína a 0.8M; dNTPs a 0.8mM; volumen de ADN 1μL; tiempo de amplificación se estableció en 60 minutos a la temperatura indicada. LAMP presentó una alta sensibilidad y especificidad (>99%).
eu_rights_str_mv	openAccess
format	bachelorThesis
id	UPS_5cd1e2a471c3a7a719742e3cfbc9393e
instacron_str	UPS
institution	UPS
instname_str	Universidad Politécnica Salesiana
language	spa
network_acronym_str	UPS
network_name_str	Repositorio Universidad Politécnica Salesiana
oai_identifier_str	oai:dspace.ups.edu.ec:123456789/16949
publishDate	2019
reponame_str	Repositorio Universidad Politécnica Salesiana
repository.mail.fl_str_mv	.
repository.name.fl_str_mv	Repositorio Universidad Politécnica Salesiana - Universidad Politécnica Salesiana
repository_id_str	1737
rights_invalid_str_mv	Atribución-NoComercial-SinDerivadas 3.0 Ecuador http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/ec/
spelling	Estandarización de un protocolo para la rápida detección del Gen Bla-KPC en Bacterias Gramnegativas resistentes a Carbapenémicos mediante el uso de LAMP (Loop Mediated Isothermal Amplification)Alejandro Paspuezan, Ronny RicardoBIOTECNOLOGÍA DE LOS RECURSOS NATURALESCARBAPENEMASASISOTÉRMICOPIROFOSFATOEn Ecuador existe gran prevalencia de bacterias portadoras de enzimas carbapenemasas que representan el principal mecanismo de resistencia frente a los antibióticos betalactámicos, utilizados en el tratamiento de infecciones respiratorias, del sistema nervioso central, intraabdominales, urinarias, endocarditis y sepsis de origen no clasificado. El gen codificante para carbapenemasas, bla-KPC-2, es el de mayor incidencia en instituciones de salud del país, según reportes del INSPI – CZ9, Centro de Referencia Nacional de Resistencia a los Antimicrobianos (CNR-RAM). Actualmente hospitales o centros de salud básicos carecen de una técnica de amplificación de ácidos nucleicos de bajo costo, rápida detección, alta sensibilidad, especificidad y capacidad para discriminar secuencias de genes de resistencia. Mediante esta investigación se estandarizó un protocolo para la rápida detección del gen bla-KPC en Enterobacterias, usando LAMP como técnica de diagnóstico clínico que pueda ser utilizada a futuro en hospitales y centros de salud básicos. Se seleccionaron del cepario del CNR-RAM, 40 cepas bacterianas: 20 positivas para bla-KPC; 11 cepas con diferentes genes de resistencia a carbapenémicos (BLEE; bla-IMP; bla-NDM; bla-OXA-48, bla-Ctx-m) y 9 que no presentaban ningún gen de resistencia, todas confirmadas previamente mediante microbiología y biología molecular. Las condiciones de amplificación de la región del gen bla-KPC, que permitieron obtener un amplicón de buena calidad fueron: temperatura a 63 °C, concentraciones de oligonucleótidos internos: FIP/BIP 0.4μM; MgSO4 desde 4mM; Betaína a 0.8M; dNTPs a 0.8mM; volumen de ADN 1μL; tiempo de amplificación se estableció en 60 minutos a la temperatura indicada. LAMP presentó una alta sensibilidad y especificidad (>99%).In Ecuador there is a high prevalence of bacteria carrying carbapenemase enzymes that represent the main mechanism of resistance against beta-lactam antibiotics, used in the treatment of respiratory infections, central nervous system, intra-abdominal, urinary, endocarditis and sepsis of unclassified origin. The gene coding for carbapenemases, bla-KPC-2, is the highest incidence in health institutions in the country, according to reports from the INSPI - CZ9, National Reference Center for Resistance to Antimicrobials (CNR-RAM). Currently hospitals or basic health centers lack a low cost nucleic acid amplification technique, rapid detection, high sensitivity, specificity and ability to discriminate resistance gene sequences. Through this research, a protocol for the rapid detection of the bla-KPC gene in Enterobacteria was standardized, using LAMP as a clinical diagnostic technique that can be used in hospitals and basic health centers in the future. 40 bacterial strains were selected from the CNR-RAM strain: 20 positive for bla-KPC; 11 strains with different resistance genes to carbapenemics (ESBL, bla-IMP, bla-NDM, bla-OXA-48, bla-Ctx-m) and 9 that did not present any resistance gene, all previously confirmed by microbiology and molecular biology. The amplification conditions of the bla-KPC gene region, which allowed to obtain a good quality amplicon were: temperature at 63 ° C, internal oligonucleotide concentrations: FIP / BIP 0.4 μM; MgSO 4 from 4mM; Betaine at 0.8M; dNTPs at 0.8mM; DNA volume 1μL; Amplification time was established in 60 minutes at the indicated temperature. LAMP presented a high sensitivity and specificity (> 99%).Karolys Gutiérrez, Germania Margarita2019-02-27T21:57:42Z2019-02-27T21:57:42Z2019-02info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisapplication/pdfhttps://dspace.ups.edu.ec/handle/123456789/16949spaAtribución-NoComercial-SinDerivadas 3.0 Ecuadorhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/ec/info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositorio Universidad Politécnica Salesianainstname:Universidad Politécnica Salesianainstacron:UPS2025-06-06T15:33:54Zoai:dspace.ups.edu.ec:123456789/16949Institucionalhttps://dspace.ups.edu.ec/Institución privadahttps://www.ups.edu.ec/https://dspace.ups.edu.ec/oai.Ecuador...opendoar:17372025-06-06T15:33:54Repositorio Universidad Politécnica Salesiana - Universidad Politécnica Salesianafalse
spellingShingle	Estandarización de un protocolo para la rápida detección del Gen Bla-KPC en Bacterias Gramnegativas resistentes a Carbapenémicos mediante el uso de LAMP (Loop Mediated Isothermal Amplification) Alejandro Paspuezan, Ronny Ricardo BIOTECNOLOGÍA DE LOS RECURSOS NATURALES CARBAPENEMASAS ISOTÉRMICO PIROFOSFATO
status_str	publishedVersion
title	Estandarización de un protocolo para la rápida detección del Gen Bla-KPC en Bacterias Gramnegativas resistentes a Carbapenémicos mediante el uso de LAMP (Loop Mediated Isothermal Amplification)
title_full	Estandarización de un protocolo para la rápida detección del Gen Bla-KPC en Bacterias Gramnegativas resistentes a Carbapenémicos mediante el uso de LAMP (Loop Mediated Isothermal Amplification)
title_fullStr	Estandarización de un protocolo para la rápida detección del Gen Bla-KPC en Bacterias Gramnegativas resistentes a Carbapenémicos mediante el uso de LAMP (Loop Mediated Isothermal Amplification)
title_full_unstemmed	Estandarización de un protocolo para la rápida detección del Gen Bla-KPC en Bacterias Gramnegativas resistentes a Carbapenémicos mediante el uso de LAMP (Loop Mediated Isothermal Amplification)
title_short	Estandarización de un protocolo para la rápida detección del Gen Bla-KPC en Bacterias Gramnegativas resistentes a Carbapenémicos mediante el uso de LAMP (Loop Mediated Isothermal Amplification)
title_sort	Estandarización de un protocolo para la rápida detección del Gen Bla-KPC en Bacterias Gramnegativas resistentes a Carbapenémicos mediante el uso de LAMP (Loop Mediated Isothermal Amplification)
topic	BIOTECNOLOGÍA DE LOS RECURSOS NATURALES CARBAPENEMASAS ISOTÉRMICO PIROFOSFATO
url	https://dspace.ups.edu.ec/handle/123456789/16949

Estandarización de un protocolo para la rápida detección del Gen Bla-KPC en Bacterias Gramnegativas resistentes a Carbapenémicos mediante el uso de LAMP (Loop Mediated Isothermal Amplification)

Títulos similares