Identificación molecular del género Caucaea (Orchidaceae) mediante el sistema Barcode y análisis químico de los aromas florales
La familia Orchidaceae es considerada una de las familias más grandes del mundo además de su importancia económica, ornamental y ecológica. Caucaea es un género de orquídeas epífitas que se distribuye en Ecuador, Colombia y Venezuela por encima de los 2500 m.s.n.m, se reconocen 23 especies descritas...
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2019
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| description | La familia Orchidaceae es considerada una de las familias más grandes del mundo además de su importancia económica, ornamental y ecológica. Caucaea es un género de orquídeas epífitas que se distribuye en Ecuador, Colombia y Venezuela por encima de los 2500 m.s.n.m, se reconocen 23 especies descritas de las cuales solo 9 han sido aceptadas, por lo tanto actualmente no existe una correcta clasificación y descripción de este género. Se recolectaron 98 muestras de diferentes orquidearios y colecciones privadas para la identificación molecular mediante el sistema BARCODE, se extrajo ADN del tejido vegetal, seguido de la amplificación de un segmento del gen matK por el método de PCR convencional para la posterior secuenciación por el método Sanger automatizado y finalmente establecer la filogenia utilizando el software Mega 7. En el árbol filogenético se agruparon las especies en 9 clados evidenciando el nivel de divergencia del gen matK y la posibilidad de definir nuevas especies presentes en el Ecuador para lo cual se sugiere investigar nuevas regiones de ADN cloroplástico y nuclear. Se elaboró un mapa de distribución de las especies estableciendo la correlación de los datos con la información filogenética, se determinó que los puntos de diversificación del género Caucaea se ubican en la zona sur del Ecuador y presenta 3 corredores biológicos. Además, se realizó el análisis químico de los aromas florales mediante cromatografía de gases acoplada a espectrometría de masas (GC-MS) de las especies que se encontraban en floración detectando un total de 95 compuestos químicos. |
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| spelling | Identificación molecular del género Caucaea (Orchidaceae) mediante el sistema Barcode y análisis químico de los aromas floralesAlbán Reinoso, Jonathan LeonardoToapanta Cantuña, Christian LeonardoBIOTECNOLOGÍA DE LOS RECURSOS NATURALESORCHIDACEAEBARCODINGCAUCAEALa familia Orchidaceae es considerada una de las familias más grandes del mundo además de su importancia económica, ornamental y ecológica. Caucaea es un género de orquídeas epífitas que se distribuye en Ecuador, Colombia y Venezuela por encima de los 2500 m.s.n.m, se reconocen 23 especies descritas de las cuales solo 9 han sido aceptadas, por lo tanto actualmente no existe una correcta clasificación y descripción de este género. Se recolectaron 98 muestras de diferentes orquidearios y colecciones privadas para la identificación molecular mediante el sistema BARCODE, se extrajo ADN del tejido vegetal, seguido de la amplificación de un segmento del gen matK por el método de PCR convencional para la posterior secuenciación por el método Sanger automatizado y finalmente establecer la filogenia utilizando el software Mega 7. En el árbol filogenético se agruparon las especies en 9 clados evidenciando el nivel de divergencia del gen matK y la posibilidad de definir nuevas especies presentes en el Ecuador para lo cual se sugiere investigar nuevas regiones de ADN cloroplástico y nuclear. Se elaboró un mapa de distribución de las especies estableciendo la correlación de los datos con la información filogenética, se determinó que los puntos de diversificación del género Caucaea se ubican en la zona sur del Ecuador y presenta 3 corredores biológicos. Además, se realizó el análisis químico de los aromas florales mediante cromatografía de gases acoplada a espectrometría de masas (GC-MS) de las especies que se encontraban en floración detectando un total de 95 compuestos químicos.The Orchidaceae family is considered one of the largest families in the world in addition to its economic, ornamental and ecological importance. Caucaea is a genus of epiphytic orchids that is distributed in Ecuador, Colombia and Venezuela above 2500 m.s.n.m, 23 species are recognized, of which only 9 have been accepted, so there is currently no correct classification and description of this genus. We collected 98 samples from different orchids and private collections for molecular identification using the BARCODE system, extracted DNA from the plant tissue, followed by the amplification of a segment of the matK gene by the conventional PCR method for subsequent sequencing using the Sanger method. automated and finally establish the phylogeny using Mega 7 software. In the phylogenetic tree, the species were grouped in 9 clades, showing the level of divergence of the matK gene and the possibility of defining new species present in Ecuador, for which it is suggested to investigate new regions of chloroplastic and nuclear DNA. A map of distribution of the species was elaborated establishing the correlation of the data with the phylogenetic information, it was determined that the points of diversification of the Caucaea genus are located in the south zone of Ecuador and it presents 3 biological corridors. In addition, the chemical analysis of the floral aromas was carried out by means of gas chromatography coupled to mass spectrometry (GC-MS) of the species that were in flowering, detecting a total of 95 chemical compounds.Cerna Cevallos, Marco Fernando2019-03-07T21:14:30Z2019-03-07T21:14:30Z2019-03info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisapplication/pdfhttps://dspace.ups.edu.ec/handle/123456789/16979spaAtribución-NoComercial-SinDerivadas 3.0 Ecuadorhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/ec/info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositorio Universidad Politécnica Salesianainstname:Universidad Politécnica Salesianainstacron:UPS2025-06-06T15:55:52Zoai:dspace.ups.edu.ec:123456789/16979Institucionalhttps://dspace.ups.edu.ec/Institución privadahttps://www.ups.edu.ec/https://dspace.ups.edu.ec/oai.Ecuador...opendoar:17372025-06-06T15:55:52Repositorio Universidad Politécnica Salesiana - Universidad Politécnica Salesianafalse |
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