Ocurrencia y caracterización de escherichia coli resistente a cefalosporina de tercera generación mediado por la familia génica blactx-m en el curso del río Isinche Latacunga.

Antibiotics use as growth promoters, prophylactics, and empiric therapies is common in small-scale animal production in Ecuador’s rural zones. These practices promote the evolution of multidrug resistant bacteria (MDR) in animals. Animal’s feces disseminate MDR to the surrounding environment and riv...

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Bibliografiske detaljer
Hovedforfatter: Bungacho Michilena, Melanie Lizeth (author)
Andre forfattere: Quezada Suárez, Priscila Arianna (author)
Format: bachelorThesis
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Udgivet: 2021
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description Antibiotics use as growth promoters, prophylactics, and empiric therapies is common in small-scale animal production in Ecuador’s rural zones. These practices promote the evolution of multidrug resistant bacteria (MDR) in animals. Animal’s feces disseminate MDR to the surrounding environment and rivers, from the contamination reaches people through the food chain. However, the characteristics of this pollution in our region remain largely unknown. Therefore, the aim of this study was to evaluate MDR pollution in a rural river, using E. coli as the fecal contamination indicator and third-generation cephalosporin- (3GC) resistance as the MDR marker. The Isinche River was sampled at 4 sampling points. Total E. coli and 3GC-resistant E. coli counts were estimated using filtration on TBX and TBX supplemented with ceftriaxone 3μg/mL. Phylogroups, blaCTX-M (Groups 1,2,8 and 9) and mcr-1 genes were studied by PCR. Susceptibility for twenty-one antibiotics belonging to 10 families was evaluated using Kirby-Bauer. SP1, at the born of the river, was free of 3GC-resistant E. coli. SP2, SP3 and SP4, influenced by animal production, showed a high contamination by 3GC-resistant E. coli, up to 8x101 3GC-resistant E. coli/mL and one 3GC-resistant E. coli/50 susceptible E. coli. One hundred four 3GC-resistant E. coli were isolated for further analysis. The isolates belonged to phylogroups D(67%), B2(13%) and A(1%). Resistance genes blaCTX-M and mcr-1 were detected in 96% and 6%, respectively. blaCTX-M Groups 1 and 9 were the most prevalent (56% and 38%), and groups 2 and 8 were registered in 1% of the isolates. This population profile is concordant with identified in community-onset infections. Using as a model Isinche River, our study provides a warning about the high potential of the rural rivers for spreading MDR E. coli. Therefore, implementing regulations based on state-of-the-art methods is strongly recommended.
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The Isinche River was sampled at 4 sampling points. Total E. coli and 3GC-resistant E. coli counts were estimated using filtration on TBX and TBX supplemented with ceftriaxone 3μg/mL. Phylogroups, blaCTX-M (Groups 1,2,8 and 9) and mcr-1 genes were studied by PCR. Susceptibility for twenty-one antibiotics belonging to 10 families was evaluated using Kirby-Bauer. SP1, at the born of the river, was free of 3GC-resistant E. coli. SP2, SP3 and SP4, influenced by animal production, showed a high contamination by 3GC-resistant E. coli, up to 8x101 3GC-resistant E. coli/mL and one 3GC-resistant E. coli/50 susceptible E. coli. One hundred four 3GC-resistant E. coli were isolated for further analysis. The isolates belonged to phylogroups D(67%), B2(13%) and A(1%). Resistance genes blaCTX-M and mcr-1 were detected in 96% and 6%, respectively. blaCTX-M Groups 1 and 9 were the most prevalent (56% and 38%), and groups 2 and 8 were registered in 1% of the isolates. This population profile is concordant with identified in community-onset infections. Using as a model Isinche River, our study provides a warning about the high potential of the rural rivers for spreading MDR E. coli. Therefore, implementing regulations based on state-of-the-art methods is strongly recommended.El uso de antibióticos como promotores de crecimiento, profilácticos y terapias empíricas es común en la producción animal a pequeña escala en las zonas rurales de Ecuador. Estas prácticas promueven la evolución de bacterias multirresistentes en animales. Las heces de animales se diseminan al medio ambiente circundante y a los ríos, mediante los cuales la contaminación llega a las personas a través de la cadena alimentaria. Sin embargo, las características de esta contaminación en nuestra región siguen siendo en gran parte desconocidas. Por lo tanto, el objetivo de este estudio fue evaluar la contaminación por bacterias multirresistentes en un río rural, utilizando E. coli como indicador de contaminación fecal y resistencia a cefalosporinas de tercera generación (3GC) como marcador de multirresistencia. El río Isinche se muestreó en 4 puntos. Los recuentos totales de E. coli y E. coli resistentes a 3GC se calcularon mediante filtración en TBX y TBX suplementados con ceftriaxona 3 μg / ml. Se estudiaron mediante PCR los genes filogrupos, blaCTX-M (Grupos 1, 2, 8 y 9) y mcr-1. La susceptibilidad a veintiún antibióticos pertenecientes a 10 familias se evaluó mediante Kirby-Bauer. SP1, en el nacimiento del río, estaba libre de E. coli resistente a 3GC. SP2, SP3 y SP4, influenciados por la producción animal, mostraron una alta contaminación por E. coli resistente a 3GC, hasta 8x101 E. coli resistente a 3GC/mL y una E. coli resistente a 3GC/ E. coli 50 susceptible. Se aislaron ciento cuatro E. coli resistentes a 3GC para su posterior análisis. Los aislamientos pertenecían a los filogrupos D (67%), B2 (13%) y A (1%). Se detectaron genes de resistencia blaCTX-M y mcr-1 en 96% y 6%, respectivamente blaCTX-M. Los grupos 1 y 9 fueron los más prevalentes (56% y 38). Este perfil de población es concordante con las identificadas en las infecciones de inicio comunitario. La población demostró multirresistencia incluida la resistencia a carbapenémicos y tigeciclina Utilizando como modelo el río Isinche, nuestro estudio proporciona una advertencia sobre el alto potencial de los ríos rurales para propagar la E. coli multirresistente. Por lo tanto, se recomienda encarecidamente implementar regulaciones basadas en métodos de última generación.Ecuador : Latacunga: Universidad Técnica de Cotopaxi (UTC)Molina Cuasapaz, Edie Gabriel2023-09-21T14:16:22Z2023-09-21T14:16:22Z2021-03info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesis68 páginasBungacho Michilena Melanie Lizeth Quezada Suárez Priscila Arianna (2023); Ocurrencia y caracterización de escherichia coli resistente a cefalosporina de tercera generación mediado por la familia génica blactx-m en el curso del río Isinche Latacunga. UTC. Latacunga. 68 p.PC-002822http://repositorio.utc.edu.ec/handle/27000/10864spahttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/ec/info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositorio Universidad Técnica de Cotopaxiinstname:Universidad Técnica de Cotopaxiinstacron:UTC2023-10-03T21:09:18Zoai:oai:repositorio.utc.edu.ec:27000:27000/10864Institucionalhttp://repositorio.utc.edu.ec/Universidad públicahttps://www.utc.edu.ec/..Ecuador...opendoar:02025-01-26T03:45:53.713538Repositorio Universidad Técnica de Cotopaxi - Universidad Técnica de Cotopaxitrue
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