Identificación de comunidades bacterianas y grupos funcionales asociados a la rizosfera de la papa (Solanum tuberosum). Var super chola en el piso altitudinal de 3100 msnm, Cuturivi, Cotopaxi 2022.

This research aimed to identify bacterial communities and determine the functional groups associated with the rhizosphere of the potato in the “Super Chola” variety (solanum tuberosum) at 3100 masl to determine the different functional groups. The methodology of (Bernal, 2015) was used in the locali...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Main Author: Armas Ochoa, Galo Sebastian (author)
Format: bachelorThesis
Language:spa
Published: 2022
Subjects:
Online Access:http://repositorio.utc.edu.ec/handle/27000/8777
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
_version_ 1822282049755545600
author Armas Ochoa, Galo Sebastian
author_facet Armas Ochoa, Galo Sebastian
author_role author
collection Repositorio Universidad Técnica de Cotopaxi
dc.contributor.none.fl_str_mv Chasi Vizuete, Paolo Wilman.
dc.creator.none.fl_str_mv Armas Ochoa, Galo Sebastian
dc.date.none.fl_str_mv 2022-07-15T20:05:24Z
2022-07-15T20:05:24Z
2022-03
dc.format.none.fl_str_mv 133 páginas
dc.identifier.none.fl_str_mv Armas Ochoa Galo Sebastián (2022); Identificación de comunidades bacterianas y grupos funcionales asociados a la rizosfera de la papa (Solanum tuberosum). Var super chola en el piso altitudinal de 3100 msnm, Cuturivi, Cotopaxi 2022. UTC. Latacunga. 133 p.
PC-002310
http://repositorio.utc.edu.ec/handle/27000/8777
dc.language.none.fl_str_mv spa
dc.publisher.none.fl_str_mv Ecuador, Latacunga: Universidad Técnica de Cotopaxi (UTC)
dc.rights.none.fl_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/ec/
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositorio Universidad Técnica de Cotopaxi
instname:Universidad Técnica de Cotopaxi
instacron:UTC
dc.subject.none.fl_str_mv COMUNIDADES BACTERIANAS
GRUPOS FUNCIONALES
METAGENÓMICOS
AGRONÓMICA
dc.title.none.fl_str_mv Identificación de comunidades bacterianas y grupos funcionales asociados a la rizosfera de la papa (Solanum tuberosum). Var super chola en el piso altitudinal de 3100 msnm, Cuturivi, Cotopaxi 2022.
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
info:eu-repo/semantics/bachelorThesis
description This research aimed to identify bacterial communities and determine the functional groups associated with the rhizosphere of the potato in the “Super Chola” variety (solanum tuberosum) at 3100 masl to determine the different functional groups. The methodology of (Bernal, 2015) was used in the locality of Cuturivi, Cotopaxi Province, where culture media are used such as Nutrient Agar (Total Microbiota), Rose Bengal (Total Population of Fungi), Ramos Callao Agar (Phosphorus solubilizers), King's B (Pseudomonas), Soil Extract Agar (Cellulitic Bacteria), Watanabe (Nitrogen Fixers) and Casein Agar (Actinomycetes). Bacterial identification was performed by sequencing 16S rRNA in soil using third-generation sequencing with nanopores (Oxford Nanopore Technologies). Additionally, a physicochemical analysis was carried out at the INIAP laboratory to know the state of soil composition. From the data, it was obtained that in this altitudinal tier, the genre with the most significant presence is Arenimonas with 2,530 accumulated readings, followed by Lactobacillus with 860 readings. These genres are related to nitrogen fixation in the soil, which is consistent with the physical analysis where values of 150 ppm of nitrogen were obtained, considered high. Five repetitions were established in soil and root plus a blind control for each group, where the number of colonies *gr-1 and CFU *gr -1 was established. The functional group with the highest number of colonies was nitrogen-fixing bacteria with 1.18*108 colonies*gr-1 in the soil, and 1.06*108 colonies*gr-1 in the root, followed by phosphorus-solubilizing bacteria with 2, 08*1012 cfu*gr-1, in soil and root with total microbiota with 9.16*1011 cfu*gr-1 respectively. So, there is also the presence in soil and root of the other groups under study. There is a relationship between the bacterial communities present with the functional groups of greater presence and the results of the levels of elements that the potato rhizosphere has.
eu_rights_str_mv openAccess
format bachelorThesis
id UTC_efafd37d6c36c0fd16633c0b141b2157
identifier_str_mv Armas Ochoa Galo Sebastián (2022); Identificación de comunidades bacterianas y grupos funcionales asociados a la rizosfera de la papa (Solanum tuberosum). Var super chola en el piso altitudinal de 3100 msnm, Cuturivi, Cotopaxi 2022. UTC. Latacunga. 133 p.
PC-002310
instacron_str UTC
institution UTC
instname_str Universidad Técnica de Cotopaxi
language spa
network_acronym_str UTC
network_name_str Repositorio Universidad Técnica de Cotopaxi
oai_identifier_str oai:oai:repositorio.utc.edu.ec:27000:27000/8777
publishDate 2022
publisher.none.fl_str_mv Ecuador, Latacunga: Universidad Técnica de Cotopaxi (UTC)
reponame_str Repositorio Universidad Técnica de Cotopaxi
repository.mail.fl_str_mv .
repository.name.fl_str_mv Repositorio Universidad Técnica de Cotopaxi - Universidad Técnica de Cotopaxi
repository_id_str 0
rights_invalid_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/ec/
spelling Identificación de comunidades bacterianas y grupos funcionales asociados a la rizosfera de la papa (Solanum tuberosum). Var super chola en el piso altitudinal de 3100 msnm, Cuturivi, Cotopaxi 2022.Armas Ochoa, Galo SebastianCOMUNIDADES BACTERIANASGRUPOS FUNCIONALESMETAGENÓMICOSAGRONÓMICAThis research aimed to identify bacterial communities and determine the functional groups associated with the rhizosphere of the potato in the “Super Chola” variety (solanum tuberosum) at 3100 masl to determine the different functional groups. The methodology of (Bernal, 2015) was used in the locality of Cuturivi, Cotopaxi Province, where culture media are used such as Nutrient Agar (Total Microbiota), Rose Bengal (Total Population of Fungi), Ramos Callao Agar (Phosphorus solubilizers), King's B (Pseudomonas), Soil Extract Agar (Cellulitic Bacteria), Watanabe (Nitrogen Fixers) and Casein Agar (Actinomycetes). Bacterial identification was performed by sequencing 16S rRNA in soil using third-generation sequencing with nanopores (Oxford Nanopore Technologies). Additionally, a physicochemical analysis was carried out at the INIAP laboratory to know the state of soil composition. From the data, it was obtained that in this altitudinal tier, the genre with the most significant presence is Arenimonas with 2,530 accumulated readings, followed by Lactobacillus with 860 readings. These genres are related to nitrogen fixation in the soil, which is consistent with the physical analysis where values of 150 ppm of nitrogen were obtained, considered high. Five repetitions were established in soil and root plus a blind control for each group, where the number of colonies *gr-1 and CFU *gr -1 was established. The functional group with the highest number of colonies was nitrogen-fixing bacteria with 1.18*108 colonies*gr-1 in the soil, and 1.06*108 colonies*gr-1 in the root, followed by phosphorus-solubilizing bacteria with 2, 08*1012 cfu*gr-1, in soil and root with total microbiota with 9.16*1011 cfu*gr-1 respectively. So, there is also the presence in soil and root of the other groups under study. There is a relationship between the bacterial communities present with the functional groups of greater presence and the results of the levels of elements that the potato rhizosphere has.La presente investigación se realizó en la localidad de Cuturivi, provincia de Cotopaxi teniendo como objetivo identificar comunidades bacterianas y determinar los grupos funcionales asociados a la rizosfera de la papa en la variedad de super chola (solanum tuberosum) a 3100 msnm, para la determinación de los diferentes grupos funcionales se utilizó la metodología de (Bernal, 2015), donde se utiliza los medios de cultivo como: Agar Nutritivo (Microbiota Total), Rosa de Bengala (Población total de Hongos), Agar Ramos Callao (Solubilizadores de fósforo), B de King (Pseudomonas), Agar Extracto de suelo (Bacterias Celulíticas), Watanabe (Fijadores de nitrógeno) y Agar Caseína (Actinomicetos). Para la identificación bacteriana se realizó mediante secuenciación del ARNr 16S en suelo, mediante la Secuenciación de tercera generación mediante nanoporos (Oxford Nanopore Technologies) y Adicional para conocer el estado de composición del suelo se realizó un análisis fisicoquímico en el laboratorio del INIAP. Con los datos se obtuvo que en este piso altitudinal los géneros con más presencia son las Arenimonas con 2,530 lecturas acumuladas, seguidas de Lactobacillus con 860 lecturas. Estos géneros están relacionados con la fijación de nitrógeno en el suelo, lo que concuerda con el análisis físico donde obtuvimos valores de 150 ppm de nitrógeno considerado alto. Por cada grupo se estableció cinco repeticiones en suelo y raíz más un testigo ciego, donde se estableció, número de colonias *gr-1 y UFC *gr -1. El grupo funcional con mayor número de colonias fue bacterias fijadoras de nitrógeno con 1,18*108 colonias*gr-1 en suelo, y en raíz 1,06*108 colonias *gr-1, seguido de bacterias solubilizadoras de fósforo con 2,08*1012 ufc*gr-1, en suelo y raíz con microbiota total con 9,16*1011 ufc*gr-1 respectivamente. Teniendo en cuenta que también hay la presencia en suelo y raíz de los demás grupos en estudio. Existe una relación entre las comunidades bacterianas presentes con los grupos funcionales de mayor presencia y los resultados de niveles de elementos que tiene la rizosfera de la papa.Ecuador, Latacunga: Universidad Técnica de Cotopaxi (UTC)Chasi Vizuete, Paolo Wilman.2022-07-15T20:05:24Z2022-07-15T20:05:24Z2022-03info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesis133 páginasArmas Ochoa Galo Sebastián (2022); Identificación de comunidades bacterianas y grupos funcionales asociados a la rizosfera de la papa (Solanum tuberosum). Var super chola en el piso altitudinal de 3100 msnm, Cuturivi, Cotopaxi 2022. UTC. Latacunga. 133 p.PC-002310http://repositorio.utc.edu.ec/handle/27000/8777spahttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/ec/info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositorio Universidad Técnica de Cotopaxiinstname:Universidad Técnica de Cotopaxiinstacron:UTC2022-07-16T08:00:57Zoai:oai:repositorio.utc.edu.ec:27000:27000/8777Institucionalhttp://repositorio.utc.edu.ec/Universidad públicahttps://www.utc.edu.ec/..Ecuador...opendoar:02025-01-26T03:45:14.697238Repositorio Universidad Técnica de Cotopaxi - Universidad Técnica de Cotopaxitrue
spellingShingle Identificación de comunidades bacterianas y grupos funcionales asociados a la rizosfera de la papa (Solanum tuberosum). Var super chola en el piso altitudinal de 3100 msnm, Cuturivi, Cotopaxi 2022.
Armas Ochoa, Galo Sebastian
COMUNIDADES BACTERIANAS
GRUPOS FUNCIONALES
METAGENÓMICOS
AGRONÓMICA
status_str publishedVersion
title Identificación de comunidades bacterianas y grupos funcionales asociados a la rizosfera de la papa (Solanum tuberosum). Var super chola en el piso altitudinal de 3100 msnm, Cuturivi, Cotopaxi 2022.
title_full Identificación de comunidades bacterianas y grupos funcionales asociados a la rizosfera de la papa (Solanum tuberosum). Var super chola en el piso altitudinal de 3100 msnm, Cuturivi, Cotopaxi 2022.
title_fullStr Identificación de comunidades bacterianas y grupos funcionales asociados a la rizosfera de la papa (Solanum tuberosum). Var super chola en el piso altitudinal de 3100 msnm, Cuturivi, Cotopaxi 2022.
title_full_unstemmed Identificación de comunidades bacterianas y grupos funcionales asociados a la rizosfera de la papa (Solanum tuberosum). Var super chola en el piso altitudinal de 3100 msnm, Cuturivi, Cotopaxi 2022.
title_short Identificación de comunidades bacterianas y grupos funcionales asociados a la rizosfera de la papa (Solanum tuberosum). Var super chola en el piso altitudinal de 3100 msnm, Cuturivi, Cotopaxi 2022.
title_sort Identificación de comunidades bacterianas y grupos funcionales asociados a la rizosfera de la papa (Solanum tuberosum). Var super chola en el piso altitudinal de 3100 msnm, Cuturivi, Cotopaxi 2022.
topic COMUNIDADES BACTERIANAS
GRUPOS FUNCIONALES
METAGENÓMICOS
AGRONÓMICA
url http://repositorio.utc.edu.ec/handle/27000/8777