Estudio preliminar de diversidad genética de Ilex guayusa en la amazonía ecuatoriana mediante marcadores moleculares ISSR

 

Authors

Mosquera Bolaños, Juan Daniel

Format

BachelorThesis

Status

publishedVersion

Description

Ilex guayusa is a plant found in the Ecuadorian Amazon. Although broadly used traditionally by various indigenous groups, the information about its history, distribution and culture is very limited. In this study, the genetic diversity of guayusa from different locations of the Sucumbíos, Napo, Orellana, Pastaza, Morona Santiago and Zamora Chinchipe provinces was determined. Twelve ISSRs primers were used on a total of 157 guayusa individuals, from which 9 amplified in 100% of the samples, giving a total of 106 bands (85.85% polymorphic) , with an average of 11.77 bands per primer. The variability between and within populations was 82% and 18% respectively. Nei genetic distances indicated a reduced genetic diversity between populations, being the distance between Napo and Zamora Chinchipe (0.0086) the greatest, and the distance between Napo and Orellana (0.013) the lowest. The population structure analysis STRUCTURE (K=2), suggested two possible ancestral lines. The first ancestral line comprised the individuals from the population of Sucumbios and some individuals from the population of Napo. The second ancestral line comprised the remaining individuals of the population of Napo and the populations of Orellana, Pastaza, Morona Santiago and Zamora Chinchipe. The division groups obtained with STRUCUTRE was supported by the Neighbor Joining (dendrogram) and cluster analysis (PCoA) inferred from genetic distances. This present study is the very first involving Ilex guayusa, making it necessary to assess a greater number of individuals from various populations with the aim of having a broader understanding of the population structure and genetic diversity of guayusa in Ecuador. Obtaining this information contributes to evaluate guayusa´s conservation status and also to develop adequate management plans such as the establishment of agroforestry systems allowing the conservation of the genetic variability of this species.
Ilex guayusa es una planta que se encuentra en la Amazonía ecuatoriana. A pesar de ser ampliamente utilizada de manera tradicional por varios grupos indígenas, la información sobre su historia, distribución y cultivo es muy limitada. En este estudio se analizó la diversidad genética de guayusa en diferentes localidades de Sucumbíos, Napo, Orellana, Pastaza, Morona Santiago y Zamora Chinchipe. Se utilizaron 12 primers ISSRs en 157 individuos de guayusa, de los cuales 9 amplificaron regiones entre microsatélites en 100% de las muestras dando un total de 106 bandas (85.85% polimórficas), con un promedio de 11.77 bandas por primer. Se obtuvo una variabilidad dentro y entre poblaciones de 82% y 18% respectivamente. Las distancias genéticas de Nei indican una diversidad genética reducida, siendo mayor la distancia entre la población de Napo y Zamora Chinchipe (0.086) y la menor entre la población de Napo y Orellana (0.013). El análisis de con STRUCTURE (K=2), sugiere dos posibles líneas ancestrales, la primera comprende los individuos de la población de Sucumbíos y parte de los individuos de la población de Napo; y la segunda el resto de individuos de Napo y de las poblaciones de las provincias de Orellana, Pastaza, Morona Santiago y Zamora Chinchipe. La agrupación obtenida con STRUCTURE se ve apoyada por el dendrograma (Neighbor Joining) y análisis de clusters (PCoA) basados en las distancias genéticas. Este es el primer estudio de diversidad genética en Ilex guayusa por lo que es necesario extender el análisis a un mayor número de poblaciones en estudios futuros, con el fin de comprender de mejor manera la estructura poblacional y diversidad genética de la guayusa en el Ecuador. El obtener esta información contribuye a evaluar el estado de conservación de la guayusa y a llevar a cabo planes de manejo adecuado como el establecimiento de sistemas agroforestales que permitan conservar la diversidad genética de ésta especie.

Publication Year

2015

Language

spa

Topic

Biotecnología
Guayusa - Genética molecular vegetal - Ecuador
CIENCIAS
BOTÁNICA

Repository

Repositorio Universidad San Francisco de Quito

Get full text

http://repositorio.usfq.edu.ec/handle/23000/4555

Rights

openAccess

License

http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/ec/