Caracterizaci?n molecular de 42 accesiones de la colecci?n de genotipos de cacao nacional (Theobroma cacao L.) de la EET Pichilingue, INIAP, mediante el uso de marcadores microsat?lites (SSRs)

 

Authors
Lozada Vargas, Pa?l Francisco
Format
BachelorThesis
Status
publishedVersion
Description

Proyecto PIC-12-INIAP-001: Desarrollo e innovaci?n biotecnol?gica para la potenciaci?n de rubros agr?colas de importancia en seguridad alimentaria, competitividad exportable y adaptaci?n al cambio.
El cacao (Theobroma cacao L.) es un cultivo importante para la econom?a de paises de clima tropical; especialmente para el Ecuador por su tradicion fina cacaotera. Debido a que las accesiones de cacao deben ser porpagadas vegetativamente, para conservar su integridad genetica, su germoplasma se mantiene en colecciones vivientes en campo; lo cual se ha convertido en un problema debido a la presencia de accesiones duplicadas, errores extraclonales, y en ?rboles mal identificados en determinadas accesiones, es decir errores intraclonales. Por este motivo los estudios en base a biolog?a molecular son de vital importancia para el establecimiento y mantenimiento de importantes colecciones de T. cacao. En el presente trabajo, se estableci? el uso de 20 microsat?lites para realizar el genotipaje, usando la tecnolog?a M13 tailing junto con el equipo LI-COR 4300S, para caracterizar y generar el perfil gen?tico de 400 ?rboles pertenecientes al Bloque I de la CGN (Colecci?n de Genotipos de Cacao Nacional) en la EET Pichilingue del INIAP. Cuarenta y dos accesiones fueron caracterizadas molecularmente, encontr?ndose que no existen errores extraclonales; sin embargo se hall? un alto n?mero de errores intraclonales. Del total de accesiones en estudio el 71.42% present? al menos 1 error intraclonal, mientras que el 28.58% no presentan ning?n error. Adem?s entre los 400 individuos analizados, se encontr? que el 21.5% present? un perfil gen?tico distinto, cayendo dentro de los errores intraplanta. Esta investigaci?n permiti? determinar una medida de diversidad g?nica (He) de 0.616; un promedio de 6.15 alelos por marcador molecular utilizado y un contenido promedio de informaci?n de polimorfismo (PIC) de 0.558. Los resultados obtenidos resaltan la importancia que tiene la inclusi?n de la biolog?a molecular para el establecimiento, mantenimiento y depuraci?n de las colecciones de germoplasma, no solo del Ecuador sino a nivel mundial. De esta manera se espera aportar m?s herramientas tecnol?gicas para el fitomejoramiento de un cultivo tan importante como el cacao.

Publication Year
2014
Language
spa
Topic
THEOBROMA CACAO L.
DIVERSIDAD
MICROSAT?LITES
BIOLOG?A MOLECULAR
GENOTIPAJE
GERMOPLASMA
CCAT
Repository
Repositorio SENESCYT
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http://repositorio.educacionsuperior.gob.ec/handle/28000/4489
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License
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